18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2225 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2225  putative branched chain amino acid transport protein  100 
 
 		 232 aa  477  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.894087  normal  0.251816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2096  DNA-binding prophage protein  78.38 
 
 		 290 aa  281  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1668  hypothetical protein  68.45 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.54325 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1655  hypothetical protein  72.73 
 
 		 294 aa  222  4e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.313803  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1364  putative DNA-binding prophage protein  56.86 
 
 		 295 aa  169  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.219092  hitchhiker  0.00163149 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3551  putative DNA-binding prophage protein  55.56 
 
 		 293 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3710  hypothetical protein  54.9 
 
 		 293 aa  161  7e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2936  DNA-binding prophage protein  53.21 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000003808 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0686  hypothetical protein  41.71 
 
 		 295 aa  141  9e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3697  hypothetical protein  45.62 
 
 		 296 aa  138  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.409883  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4062  hypothetical protein  38.38 
 
 		 299 aa  130  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00820855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0390  hypothetical protein  40.62 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.644255 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4127  hypothetical protein  40.62 
 
 		 295 aa  123  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0684  hypothetical protein  34.57 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0312  DNA-binding prophage protein  48.28 
 
 		 89 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0632325  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3746  hypothetical protein  30.37 
 
 		 365 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.864232  normal  0.363371 
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4043  putative integrase  26.43 
 
 		 287 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0361  Phage integrase  25.81 
 
 		 318 aa  42.4  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010858  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>