26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1655 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_1655  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  598  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.313803  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1668  hypothetical protein  96.94 
 
 		 294 aa  580  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.54325 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2096  DNA-binding prophage protein  72.82 
 
 		 290 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3710  hypothetical protein  59.23 
 
 		 293 aa  350  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3551  putative DNA-binding prophage protein  58.89 
 
 		 293 aa  348  9e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1364  putative DNA-binding prophage protein  58.19 
 
 		 295 aa  339  2.9999999999999998e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.219092  hitchhiker  0.00163149 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2936  DNA-binding prophage protein  57.44 
 
 		 291 aa  338  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000003808 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0390  hypothetical protein  48.1 
 
 		 295 aa  289  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.644255 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0686  hypothetical protein  47.75 
 
 		 295 aa  288  8e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4127  hypothetical protein  47.75 
 
 		 295 aa  283  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4062  hypothetical protein  48.08 
 
 		 299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00820855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3697  hypothetical protein  47.06 
 
 		 296 aa  283  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.409883  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2225  putative branched chain amino acid transport protein  72.73 
 
 		 232 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.894087  normal  0.251816 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0908  hypothetical protein  43.14 
 
 		 166 aa  123  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3746  hypothetical protein  31.74 
 
 		 365 aa  112  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.864232  normal  0.363371 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0312  DNA-binding prophage protein  69.23 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0632325  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0361  Phage integrase  26.02 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0684  hypothetical protein  33.67 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4043  putative integrase  26.47 
 
 		 287 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0833  hypothetical protein  26.27 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2375  hypothetical protein  26.82 
 
 		 258 aa  49.7  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2794  phage integrase family protein  23.74 
 
 		 320 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4962  hypothetical protein  26.69 
 
 		 487 aa  47.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0938  hypothetical protein  28.82 
 
 		 307 aa  44.3  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.404777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0627  putative integrase  23.83 
 
 		 288 aa  42.7  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0499  phage integrase family protein  25.86 
 
 		 285 aa  42.4  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>