30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3551 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3551  putative DNA-binding prophage protein  100 
 
 
293 aa  593  1e-168  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3710  hypothetical protein  96.59 
 
 
293 aa  570  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1364  putative DNA-binding prophage protein  72.85 
 
 
295 aa  443  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.219092  hitchhiker  0.00163149 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2096  DNA-binding prophage protein  60.55 
 
 
290 aa  361  8e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1655  hypothetical protein  58.89 
 
 
294 aa  348  9e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.313803  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1668  hypothetical protein  58.54 
 
 
294 aa  346  3e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.54325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2936  DNA-binding prophage protein  58.54 
 
 
291 aa  339  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000003808 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0390  hypothetical protein  50.51 
 
 
295 aa  305  5.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.644255 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4127  hypothetical protein  50.17 
 
 
295 aa  292  4e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0686  hypothetical protein  46.44 
 
 
295 aa  290  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4062  hypothetical protein  49.48 
 
 
299 aa  290  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00820855  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3697  hypothetical protein  47.6 
 
 
296 aa  288  5.0000000000000004e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.409883  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2225  putative branched chain amino acid transport protein  55.56 
 
 
232 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.894087  normal  0.251816 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0908  hypothetical protein  41.56 
 
 
166 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3746  hypothetical protein  33 
 
 
365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.864232  normal  0.363371 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0361  Phage integrase  26.79 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010858  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0312  DNA-binding prophage protein  53.57 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0632325  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1415  integrase family protein  26.58 
 
 
316 aa  62.4  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2375  hypothetical protein  25 
 
 
258 aa  60.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4043  putative integrase  26.12 
 
 
287 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0499  phage integrase family protein  27.06 
 
 
285 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2794  phage integrase family protein  24.74 
 
 
320 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0684  hypothetical protein  32.99 
 
 
240 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2945  phage integrase  24.44 
 
 
316 aa  52.8  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.79215e-44  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3859  putative integrase  26.91 
 
 
305 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0833  hypothetical protein  26.67 
 
 
298 aa  47.4  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0008  phage integrase family protein  23.92 
 
 
325 aa  46.2  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174514  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0627  putative integrase  25.19 
 
 
288 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  23.23 
 
 
308 aa  43.1  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4962  hypothetical protein  23.14 
 
 
487 aa  42.7  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.160649 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>