35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2096 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B2096  DNA-binding prophage protein  100 
 
 
290 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1668  hypothetical protein  72.82 
 
 
294 aa  434  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.54325 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1655  hypothetical protein  72.82 
 
 
294 aa  432  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.313803  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3551  putative DNA-binding prophage protein  60.55 
 
 
293 aa  361  8e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3710  hypothetical protein  60.21 
 
 
293 aa  360  1e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1364  putative DNA-binding prophage protein  60.21 
 
 
295 aa  360  1e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.219092  hitchhiker  0.00163149 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2936  DNA-binding prophage protein  59.93 
 
 
291 aa  342  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000003808 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0686  hypothetical protein  50.17 
 
 
295 aa  292  4e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3697  hypothetical protein  48.29 
 
 
296 aa  287  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.409883  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0390  hypothetical protein  48.11 
 
 
295 aa  285  5.999999999999999e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.644255 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4062  hypothetical protein  48.44 
 
 
299 aa  281  7.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00820855  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4127  hypothetical protein  46.74 
 
 
295 aa  275  8e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2225  putative branched chain amino acid transport protein  78.38 
 
 
232 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.894087  normal  0.251816 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0908  hypothetical protein  40.65 
 
 
166 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3746  hypothetical protein  32.08 
 
 
365 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.864232  normal  0.363371 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0312  DNA-binding prophage protein  44.33 
 
 
89 aa  69.3  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0632325  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4043  putative integrase  27.73 
 
 
287 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0684  hypothetical protein  33.67 
 
 
240 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0361  Phage integrase  25.19 
 
 
318 aa  56.6  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010858  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0833  hypothetical protein  30.61 
 
 
298 aa  56.6  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2945  phage integrase  24.52 
 
 
316 aa  53.5  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.79215e-44  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2375  hypothetical protein  27.68 
 
 
258 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0627  putative integrase  24.52 
 
 
288 aa  49.3  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2794  phage integrase family protein  24.12 
 
 
320 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4962  hypothetical protein  26.89 
 
 
487 aa  46.2  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2404  hypothetical protein  24.27 
 
 
300 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3859  putative integrase  28.8 
 
 
305 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1553  hypothetical protein  26.27 
 
 
487 aa  44.3  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.774815 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1048  hypothetical protein  22.41 
 
 
299 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1013  hypothetical protein  22.41 
 
 
299 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3693  hypothetical protein  23.36 
 
 
299 aa  43.5  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.713079  normal  0.792602 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3714  tyrosine recombinase XerD  23.21 
 
 
301 aa  43.1  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01684  hypothetical protein  21.99 
 
 
337 aa  42.7  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0499  phage integrase family protein  25.97 
 
 
285 aa  42.4  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0938  hypothetical protein  27.87 
 
 
307 aa  42.4  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.404777  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>