84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2945 on replicon NC_010715
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010715  Nther_2945  phage integrase  100 
 
 		 316 aa  656    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.79215e-44  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1415  integrase family protein  31.85 
 
 		 316 aa  162  7e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0361  Phage integrase  32.6 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2794  phage integrase family protein  27.92 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0499  phage integrase family protein  31.07 
 
 		 285 aa  138  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4962  hypothetical protein  27.49 
 
 		 487 aa  60.5  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.05 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.27 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4770  hypothetical protein  23.55 
 
 		 488 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0746  Phage integrase  24.49 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1553  hypothetical protein  25.69 
 
 		 487 aa  55.8  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.774815 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3859  putative integrase  24.04 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52320  integrase  24.47 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554417  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2096  DNA-binding prophage protein  24.52 
 
 		 290 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  25.79 
 
 		 295 aa  53.9  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  24.07 
 
 		 296 aa  53.9  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0833  hypothetical protein  22.74 
 
 		 298 aa  52.8  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  24.15 
 
 		 288 aa  53.1  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6273  helix-turn-helix, Fis-type  27.47 
 
 		 384 aa  52.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3551  putative DNA-binding prophage protein  24.44 
 
 		 293 aa  52.8  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.87 
 
 		 324 aa  52.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  28.57 
 
 		 296 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1356  hypothetical protein  54.17 
 
 		 76 aa  52  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.527083  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1414  hypothetical protein  28.57 
 
 		 126 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2496  hypothetical protein  23.98 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  24.84 
 
 		 295 aa  50.4  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2936  DNA-binding prophage protein  23.83 
 
 		 291 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000003808 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1555  tyrosine recombinase XerD  25.6 
 
 		 290 aa  50.4  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5579  Fis family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 376 aa  50.1  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1587  phage integrase family protein  22.44 
 
 		 321 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.64 
 
 		 296 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.64 
 
 		 296 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  24.14 
 
 		 296 aa  49.3  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4608  phage integrase family protein  25.09 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168393 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6537  Fis family transcriptional regulator  25 
 
 		 380 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3710  hypothetical protein  23.68 
 
 		 293 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.64 
 
 		 296 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1431  phage integrase family protein  32.6 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.56 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.56 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0950  hypothetical protein  19.4 
 
 		 313 aa  48.5  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.785839  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1015  hypothetical protein  22.3 
 
 		 322 aa  47.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0906431  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3746  hypothetical protein  23.02 
 
 		 365 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.864232  normal  0.363371 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  25.44 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0627  putative integrase  24.09 
 
 		 288 aa  47.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0938  hypothetical protein  28.18 
 
 		 307 aa  47.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.404777  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.56 
 
 		 296 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0238  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.21 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0625179  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.56 
 
 		 296 aa  47  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.56 
 
 		 296 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.56 
 
 		 296 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.56 
 
 		 296 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1847  integrase family protein  27.32 
 
 		 314 aa  47  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  25.87 
 
 		 291 aa  47  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3695  hypothetical protein  27.49 
 
 		 311 aa  46.2  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.483298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1364  putative DNA-binding prophage protein  24.56 
 
 		 295 aa  46.2  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.219092  hitchhiker  0.00163149 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  24.42 
 
 		 285 aa  46.2  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2116  hypothetical protein  23.17 
 
 		 322 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  26.43 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.34 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  22.04 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  27.84 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2244  phage integrase family protein  26.22 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1557  transcriptional regulator, Fis family  21.63 
 
 		 395 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3693  hypothetical protein  21.95 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.713079  normal  0.792602 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5221  transcriptional regulator, Fis family  21.63 
 
 		 395 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.766336 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2404  hypothetical protein  21.43 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  25.53 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  27.91 
 
 		 300 aa  43.9  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  27.84 
 
 		 311 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  24.36 
 
 		 290 aa  43.9  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1846  integrase family protein  24.15 
 
 		 370 aa  43.5  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000018136  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  22.9 
 
 		 311 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  28.05 
 
 		 295 aa  43.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0116  Phage integrase, N-terminal SAM- like  21.38 
 
 		 309 aa  43.1  0.006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 309 aa  43.1  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1468  phage integrase family protein  26.24 
 
 		 304 aa  42.7  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012037  Athe_2777  hypothetical protein  25.91 
 
 		 330 aa  42.7  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1668  hypothetical protein  23.37 
 
 		 294 aa  42.7  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.54325 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  29.08 
 
 		 302 aa  42.7  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0950  integrase/recombinase XerD  25.41 
 
 		 300 aa  42.7  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3449  tyrosine recombinase XerD  25.18 
 
 		 300 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0390  hypothetical protein  23.42 
 
 		 295 aa  42.4  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.644255 
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4043  putative integrase  23.44 
 
 		 287 aa  42.4  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>