57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_4043 on replicon NC_008320
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008320  Shewmr7_4043  putative integrase  100 
 
 		 287 aa  588  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0627  putative integrase  46.85 
 
 		 288 aa  267  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52320  integrase  48.25 
 
 		 287 aa  265  4e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554417  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3859  putative integrase  40.44 
 
 		 305 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2496  hypothetical protein  36.52 
 
 		 298 aa  173  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2404  hypothetical protein  36.86 
 
 		 300 aa  172  7.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1048  hypothetical protein  34.25 
 
 		 299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1013  hypothetical protein  34.25 
 
 		 299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4962  hypothetical protein  31.43 
 
 		 487 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1553  hypothetical protein  31.79 
 
 		 487 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.774815 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5579  Fis family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 376 aa  93.6  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5221  transcriptional regulator, Fis family  29.76 
 
 		 395 aa  92.8  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.766336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1557  transcriptional regulator, Fis family  29.76 
 
 		 395 aa  92.8  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6537  Fis family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 380 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4770  hypothetical protein  28.92 
 
 		 488 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6273  helix-turn-helix, Fis-type  30.38 
 
 		 384 aa  89.7  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3693  hypothetical protein  27.95 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.713079  normal  0.792602 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1587  phage integrase family protein  34.64 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4165  phage integrase, N-terminal SAM-like protein  28.57 
 
 		 386 aa  82.4  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.503266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1599  hypothetical protein  28.25 
 
 		 376 aa  79  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.920348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0833  hypothetical protein  28.14 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2403  hypothetical protein  26.72 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2375  hypothetical protein  29.27 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2218  hypothetical protein  27.67 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4486  hypothetical protein  26.33 
 
 		 534 aa  67  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0499  phage integrase family protein  27 
 
 		 285 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2096  DNA-binding prophage protein  27.73 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5432  hypothetical protein  28.99 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4062  hypothetical protein  26.14 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00820855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3710  hypothetical protein  26.64 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0390  hypothetical protein  26.06 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.644255 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1364  putative DNA-binding prophage protein  25.93 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.219092  hitchhiker  0.00163149 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1014  hypothetical protein  24.02 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0361  Phage integrase  25.48 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2531  Phage integrase, N-terminal SAM-like  24.73 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.335158 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4349  phage integrase family protein  24.83 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3551  putative DNA-binding prophage protein  26.12 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0686  hypothetical protein  30 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2936  DNA-binding prophage protein  29.64 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000003808 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1324  hypothetical protein  30.43 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.12189  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0746  Phage integrase  36.57 
 
 		 326 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1655  hypothetical protein  26.47 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.313803  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1668  hypothetical protein  26.58 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.54325 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0938  hypothetical protein  29.57 
 
 		 307 aa  55.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.404777  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1049  hypothetical protein  24.58 
 
 		 268 aa  53.9  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4127  hypothetical protein  26.75 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01684  hypothetical protein  26 
 
 		 337 aa  53.1  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1415  integrase family protein  25 
 
 		 316 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4936  phage integrase  25.31 
 
 		 326 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0598447  hitchhiker  0.0000000940352 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2794  phage integrase family protein  22.78 
 
 		 320 aa  48.9  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2495  hypothetical protein  24.35 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5433  hypothetical protein  24.82 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.802569 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4608  phage integrase family protein  28.24 
 
 		 326 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0686  phage integrase  31.58 
 
 		 326 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00180883  unclonable  0.0000000000000101632 
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1356  hypothetical protein  30.34 
 
 		 76 aa  42.4  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.527083  n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2945  phage integrase  23.44 
 
 		 316 aa  42.4  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.79215e-44  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1074  hypothetical protein  21.79 
 
 		 269 aa  42.4  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>