35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6537 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5579  Fis family transcriptional regulator  84.84 
 
 		 376 aa  649    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6537  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 		 380 aa  773    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6273  helix-turn-helix, Fis-type  49.61 
 
 		 384 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5221  transcriptional regulator, Fis family  49.21 
 
 		 395 aa  318  9e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.766336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1557  transcriptional regulator, Fis family  49.21 
 
 		 395 aa  318  9e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4770  hypothetical protein  31.29 
 
 		 488 aa  146  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4962  hypothetical protein  31.51 
 
 		 487 aa  135  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1553  hypothetical protein  32.15 
 
 		 487 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.774815 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2531  Phage integrase, N-terminal SAM-like  31.28 
 
 		 399 aa  130  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.335158 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4165  phage integrase, N-terminal SAM-like protein  31.23 
 
 		 386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.503266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2218  hypothetical protein  31.29 
 
 		 403 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1599  hypothetical protein  30.64 
 
 		 376 aa  119  9e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.920348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52320  integrase  33.67 
 
 		 287 aa  109  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554417  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4349  phage integrase family protein  27.53 
 
 		 429 aa  100  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3859  putative integrase  28.76 
 
 		 305 aa  99.4  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0627  putative integrase  30.03 
 
 		 288 aa  99  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5432  hypothetical protein  30.79 
 
 		 411 aa  98.2  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3693  hypothetical protein  28.77 
 
 		 299 aa  96.3  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.713079  normal  0.792602 
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4043  putative integrase  29.55 
 
 		 287 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2496  hypothetical protein  28.48 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2404  hypothetical protein  29.1 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4486  hypothetical protein  29.55 
 
 		 534 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1587  phage integrase family protein  30.99 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1013  hypothetical protein  25.35 
 
 		 299 aa  72  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1048  hypothetical protein  25.35 
 
 		 299 aa  72  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0833  hypothetical protein  32.07 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0938  hypothetical protein  33.56 
 
 		 307 aa  59.3  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.404777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01684  hypothetical protein  27.06 
 
 		 337 aa  55.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2375  hypothetical protein  25.37 
 
 		 258 aa  53.9  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1324  hypothetical protein  27.74 
 
 		 306 aa  51.6  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.12189  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3743  hypothetical protein  32 
 
 		 162 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.786232 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2945  phage integrase  25 
 
 		 316 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.79215e-44  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2936  DNA-binding prophage protein  24.19 
 
 		 291 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000003808 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0390  hypothetical protein  23.78 
 
 		 295 aa  43.1  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.644255 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4895  Fis family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 615 aa  42.7  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695547  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>