29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2936 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2936  DNA-binding prophage protein  100 
 
 		 291 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000003808 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2096  DNA-binding prophage protein  59.93 
 
 		 290 aa  342  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1364  putative DNA-binding prophage protein  58.19 
 
 		 295 aa  340  2e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.219092  hitchhiker  0.00163149 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3551  putative DNA-binding prophage protein  58.54 
 
 		 293 aa  339  2.9999999999999998e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3710  hypothetical protein  58.54 
 
 		 293 aa  339  4e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1655  hypothetical protein  57.44 
 
 		 294 aa  338  4e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.313803  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1668  hypothetical protein  57.44 
 
 		 294 aa  338  5e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.54325 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0686  hypothetical protein  47.1 
 
 		 295 aa  280  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0390  hypothetical protein  47.1 
 
 		 295 aa  274  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.644255 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3697  hypothetical protein  47.75 
 
 		 296 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.409883  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4062  hypothetical protein  48.6 
 
 		 299 aa  268  5.9999999999999995e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00820855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4127  hypothetical protein  45.67 
 
 		 295 aa  257  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2225  putative branched chain amino acid transport protein  53.21 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.894087  normal  0.251816 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0908  hypothetical protein  43.14 
 
 		 166 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3746  hypothetical protein  32.09 
 
 		 365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.864232  normal  0.363371 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0627  putative integrase  27.27 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4043  putative integrase  29.64 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3859  putative integrase  29.61 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0361  Phage integrase  25.3 
 
 		 318 aa  53.1  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0312  DNA-binding prophage protein  49.06 
 
 		 89 aa  52.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0632325  n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2945  phage integrase  23.83 
 
 		 316 aa  50.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.79215e-44  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0008  phage integrase family protein  23.31 
 
 		 325 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174514  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52320  integrase  27.42 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554417  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0684  hypothetical protein  30.61 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1553  hypothetical protein  25.44 
 
 		 487 aa  46.6  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.774815 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2375  hypothetical protein  28.37 
 
 		 258 aa  46.2  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6537  Fis family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 380 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4962  hypothetical protein  23.67 
 
 		 487 aa  43.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2218  hypothetical protein  28.19 
 
 		 403 aa  42.7  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.377674 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>