34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3693 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3693  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  619  1e-176  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.713079  normal  0.792602 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4349  phage integrase family protein  42.77 
 
 		 429 aa  235  8e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4770  hypothetical protein  32.91 
 
 		 488 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2218  hypothetical protein  34.9 
 
 		 403 aa  123  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2531  Phage integrase, N-terminal SAM-like  32.6 
 
 		 399 aa  113  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.335158 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1553  hypothetical protein  31.17 
 
 		 487 aa  113  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.774815 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4962  hypothetical protein  32.03 
 
 		 487 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5579  Fis family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1599  hypothetical protein  30.07 
 
 		 376 aa  102  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.920348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6537  Fis family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 380 aa  96.3  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4165  phage integrase, N-terminal SAM-like protein  28.36 
 
 		 386 aa  95.5  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.503266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52320  integrase  28.99 
 
 		 287 aa  95.1  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554417  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6273  helix-turn-helix, Fis-type  27.82 
 
 		 384 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4486  hypothetical protein  28.97 
 
 		 534 aa  90.1  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5432  hypothetical protein  29.23 
 
 		 411 aa  89.4  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4043  putative integrase  27.95 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3859  putative integrase  26.94 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2496  hypothetical protein  26.03 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0627  putative integrase  27.34 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1013  hypothetical protein  25.87 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1048  hypothetical protein  25.87 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2404  hypothetical protein  24.91 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5221  transcriptional regulator, Fis family  26.76 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.766336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1557  transcriptional regulator, Fis family  26.76 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4062  hypothetical protein  24.38 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00820855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0390  hypothetical protein  22.08 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.644255 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0361  Phage integrase  24.29 
 
 		 318 aa  53.1  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0833  hypothetical protein  25.09 
 
 		 298 aa  53.1  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2403  hypothetical protein  22.77 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4127  hypothetical protein  23.25 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1415  integrase family protein  22.02 
 
 		 316 aa  46.2  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3697  hypothetical protein  23.02 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.409883  n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2945  phage integrase  21.95 
 
 		 316 aa  44.3  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.79215e-44  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2096  DNA-binding prophage protein  23.36 
 
 		 290 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>