25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5432 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5432  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  839    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2531  Phage integrase, N-terminal SAM-like  31.17 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.335158 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4165  phage integrase, N-terminal SAM-like protein  31.3 
 
 		 386 aa  126  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.503266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6273  helix-turn-helix, Fis-type  30.79 
 
 		 384 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1599  hypothetical protein  29.79 
 
 		 376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.920348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4770  hypothetical protein  29.18 
 
 		 488 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5221  transcriptional regulator, Fis family  31.42 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.766336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1557  transcriptional regulator, Fis family  31.42 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2218  hypothetical protein  31.07 
 
 		 403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5579  Fis family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 376 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6537  Fis family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 380 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4349  phage integrase family protein  27.44 
 
 		 429 aa  89.4  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3693  hypothetical protein  29.23 
 
 		 299 aa  89.4  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.713079  normal  0.792602 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4962  hypothetical protein  30.88 
 
 		 487 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4486  hypothetical protein  30.18 
 
 		 534 aa  71.2  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1553  hypothetical protein  30.36 
 
 		 487 aa  70.9  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.774815 
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4043  putative integrase  28.99 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0746  Phage integrase  25.08 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2375  hypothetical protein  24.16 
 
 		 258 aa  55.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1587  phage integrase family protein  23.91 
 
 		 321 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4936  phage integrase  27.69 
 
 		 326 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0598447  hitchhiker  0.0000000940352 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01684  hypothetical protein  25.72 
 
 		 337 aa  51.6  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0938  hypothetical protein  29.06 
 
 		 307 aa  50.4  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.404777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1324  hypothetical protein  28.16 
 
 		 306 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.12189  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0686  phage integrase  28.2 
 
 		 326 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00180883  unclonable  0.0000000000000101632 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>