43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1013 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1048  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  617  1e-176  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1013  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  617  1e-176  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2496  hypothetical protein  63.18 
 
 		 298 aa  397  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2404  hypothetical protein  60.2 
 
 		 300 aa  390  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0627  putative integrase  36.49 
 
 		 288 aa  186  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4043  putative integrase  34.25 
 
 		 287 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52320  integrase  34.92 
 
 		 287 aa  166  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554417  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3859  putative integrase  34.72 
 
 		 305 aa  157  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4962  hypothetical protein  24.92 
 
 		 487 aa  83.2  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1587  phage integrase family protein  28.35 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1553  hypothetical protein  24.84 
 
 		 487 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.774815 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5579  Fis family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0833  hypothetical protein  34.72 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1599  hypothetical protein  26.38 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.920348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3693  hypothetical protein  25.87 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.713079  normal  0.792602 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6537  Fis family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 380 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2531  Phage integrase, N-terminal SAM-like  25.88 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.335158 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4349  phage integrase family protein  24.35 
 
 		 429 aa  68.9  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6273  helix-turn-helix, Fis-type  25.45 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2218  hypothetical protein  26.77 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4165  phage integrase, N-terminal SAM-like protein  24.82 
 
 		 386 aa  62.8  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.503266  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1074  hypothetical protein  22.58 
 
 		 269 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1324  hypothetical protein  28.79 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.12189  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4770  hypothetical protein  25.57 
 
 		 488 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0746  Phage integrase  30.49 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5221  transcriptional regulator, Fis family  25.9 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.766336 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4486  hypothetical protein  27.4 
 
 		 534 aa  57  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1557  transcriptional regulator, Fis family  25.9 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2403  hypothetical protein  22.86 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0361  Phage integrase  23.21 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010858  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1014  hypothetical protein  21.66 
 
 		 268 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1415  integrase family protein  23.63 
 
 		 316 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2375  hypothetical protein  26.38 
 
 		 258 aa  52.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2495  hypothetical protein  25.33 
 
 		 269 aa  49.7  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1049  hypothetical protein  20.39 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4608  phage integrase family protein  31.48 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168393 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0938  hypothetical protein  28.85 
 
 		 307 aa  45.8  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.404777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5432  hypothetical protein  23.13 
 
 		 411 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0686  phage integrase  32.41 
 
 		 326 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00180883  unclonable  0.0000000000000101632 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2096  DNA-binding prophage protein  22.41 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1668  hypothetical protein  23.68 
 
 		 294 aa  42.7  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.54325 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4936  phage integrase  28.32 
 
 		 326 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0598447  hitchhiker  0.0000000940352 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01684  hypothetical protein  26.46 
 
 		 337 aa  42.4  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>