30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2375 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2375  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  531  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4043  putative integrase  29.27 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01684  hypothetical protein  29.15 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3551  putative DNA-binding prophage protein  25 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5579  Fis family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3710  hypothetical protein  25.38 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52320  integrase  30.52 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554417  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0390  hypothetical protein  27.5 
 
 		 295 aa  57  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.644255 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5432  hypothetical protein  24.16 
 
 		 411 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3859  putative integrase  26.52 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0686  hypothetical protein  29.68 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6537  Fis family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 380 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1668  hypothetical protein  27.27 
 
 		 294 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.54325 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1013  hypothetical protein  26.38 
 
 		 299 aa  52.4  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1048  hypothetical protein  26.38 
 
 		 299 aa  52.4  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2096  DNA-binding prophage protein  27.68 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1655  hypothetical protein  26.82 
 
 		 294 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.313803  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2794  phage integrase family protein  25.9 
 
 		 320 aa  49.3  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1599  hypothetical protein  25.26 
 
 		 376 aa  49.3  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.920348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0627  putative integrase  26.23 
 
 		 288 aa  49.3  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3697  hypothetical protein  28.71 
 
 		 296 aa  48.9  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.409883  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1364  putative DNA-binding prophage protein  22.48 
 
 		 295 aa  48.9  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.219092  hitchhiker  0.00163149 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4632  integrase family protein  34.85 
 
 		 380 aa  46.6  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3444  Site-specific recombinase XerD-like protein  32.53 
 
 		 403 aa  46.6  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.862055  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1587  phage integrase family protein  24.49 
 
 		 321 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2936  DNA-binding prophage protein  28.37 
 
 		 291 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000003808 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2218  hypothetical protein  26.62 
 
 		 403 aa  45.8  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2496  hypothetical protein  24.38 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2531  Phage integrase, N-terminal SAM-like  23.16 
 
 		 399 aa  43.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.335158 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4062  hypothetical protein  24.7 
 
 		 299 aa  42  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00820855  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>