25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01684 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01684  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  704    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1587  phage integrase family protein  36.73 
 
 
321 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0833  hypothetical protein  31.21 
 
 
298 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0938  hypothetical protein  28.83 
 
 
307 aa  91.3  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.404777  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0746  Phage integrase  26.1 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2375  hypothetical protein  29.15 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2496  hypothetical protein  27.46 
 
 
298 aa  67  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4608  phage integrase family protein  25.63 
 
 
326 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168393 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1324  hypothetical protein  25.86 
 
 
306 aa  67.4  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.12189  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4936  phage integrase  22.39 
 
 
326 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0598447  hitchhiker  0.0000000940352 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5579  Fis family transcriptional regulator  26.13 
 
 
376 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0686  phage integrase  22.96 
 
 
326 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00180883  unclonable  0.0000000000000101632 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0361  Phage integrase  24.12 
 
 
318 aa  57  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010858  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6537  Fis family transcriptional regulator  27.06 
 
 
380 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2404  hypothetical protein  28.43 
 
 
300 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4043  putative integrase  26 
 
 
287 aa  53.1  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5432  hypothetical protein  25.72 
 
 
411 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3859  putative integrase  26.46 
 
 
305 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0627  putative integrase  27.43 
 
 
288 aa  49.7  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2794  phage integrase family protein  27.84 
 
 
320 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0686  hypothetical protein  28.12 
 
 
295 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4962  hypothetical protein  24.8 
 
 
487 aa  47  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1553  hypothetical protein  24.51 
 
 
487 aa  46.6  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.774815 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1415  integrase family protein  21.67 
 
 
316 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2096  DNA-binding prophage protein  21.99 
 
 
290 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>