22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4936 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4936  phage integrase  100 
 
 		 326 aa  666    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0598447  hitchhiker  0.0000000940352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0686  phage integrase  83.95 
 
 		 326 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00180883  unclonable  0.0000000000000101632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0746  Phage integrase  69.85 
 
 		 326 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4608  phage integrase family protein  66.46 
 
 		 326 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168393 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0938  hypothetical protein  35.42 
 
 		 307 aa  162  6e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.404777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1587  phage integrase family protein  33.03 
 
 		 321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0833  hypothetical protein  30.32 
 
 		 298 aa  99.8  5e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1324  hypothetical protein  26.92 
 
 		 306 aa  92.8  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.12189  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3859  putative integrase  33.72 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01684  hypothetical protein  22.39 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4165  phage integrase, N-terminal SAM-like protein  30.41 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.503266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2794  phage integrase family protein  29.78 
 
 		 320 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5432  hypothetical protein  27.69 
 
 		 411 aa  52.8  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0627  putative integrase  31.93 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4043  putative integrase  25.31 
 
 		 287 aa  50.1  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4486  hypothetical protein  29.28 
 
 		 534 aa  49.7  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52320  integrase  35.14 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554417  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1553  hypothetical protein  27.55 
 
 		 487 aa  47.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.774815 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4962  hypothetical protein  25.97 
 
 		 487 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2496  hypothetical protein  36.11 
 
 		 298 aa  43.9  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1557  transcriptional regulator, Fis family  29.71 
 
 		 395 aa  42.7  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5221  transcriptional regulator, Fis family  29.71 
 
 		 395 aa  42.7  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.766336 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>