45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1553 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1553  hypothetical protein  100 
 
 		 487 aa  1001    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.774815 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4962  hypothetical protein  88.3 
 
 		 487 aa  898    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5579  Fis family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 376 aa  137  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6537  Fis family transcriptional regulator  32.15 
 
 		 380 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4770  hypothetical protein  27.4 
 
 		 488 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3693  hypothetical protein  31.17 
 
 		 299 aa  113  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.713079  normal  0.792602 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4486  hypothetical protein  30.29 
 
 		 534 aa  107  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6273  helix-turn-helix, Fis-type  30.06 
 
 		 384 aa  105  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5221  transcriptional regulator, Fis family  31.19 
 
 		 395 aa  103  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.766336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1557  transcriptional regulator, Fis family  31.19 
 
 		 395 aa  103  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2496  hypothetical protein  29.49 
 
 		 298 aa  101  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4043  putative integrase  31.79 
 
 		 287 aa  101  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0627  putative integrase  29.79 
 
 		 288 aa  95.5  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4165  phage integrase, N-terminal SAM-like protein  30.96 
 
 		 386 aa  94  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.503266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52320  integrase  31.09 
 
 		 287 aa  88.2  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554417  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2404  hypothetical protein  27.36 
 
 		 300 aa  86.7  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1048  hypothetical protein  24.84 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1013  hypothetical protein  24.84 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1599  hypothetical protein  28.57 
 
 		 376 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.920348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2218  hypothetical protein  27.78 
 
 		 403 aa  78.2  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4349  phage integrase family protein  28.27 
 
 		 429 aa  77.8  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3859  putative integrase  28.03 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2531  Phage integrase, N-terminal SAM-like  26.15 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.335158 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5432  hypothetical protein  30.36 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0833  hypothetical protein  30.98 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1587  phage integrase family protein  28.81 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1324  hypothetical protein  30.36 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.12189  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0938  hypothetical protein  33.14 
 
 		 307 aa  55.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.404777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0746  Phage integrase  28.21 
 
 		 326 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2945  phage integrase  25.69 
 
 		 316 aa  55.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.79215e-44  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4062  hypothetical protein  25.64 
 
 		 299 aa  53.5  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00820855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4608  phage integrase family protein  28.74 
 
 		 326 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0686  phage integrase  26.62 
 
 		 326 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00180883  unclonable  0.0000000000000101632 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0390  hypothetical protein  24.04 
 
 		 295 aa  47.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.644255 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4936  phage integrase  27.55 
 
 		 326 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0598447  hitchhiker  0.0000000940352 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01684  hypothetical protein  24.51 
 
 		 337 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  24.85 
 
 		 295 aa  46.6  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0361  Phage integrase  24.42 
 
 		 318 aa  46.6  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2936  DNA-binding prophage protein  25.44 
 
 		 291 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000003808 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4127  hypothetical protein  23.25 
 
 		 295 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0908  hypothetical protein  29.51 
 
 		 166 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2096  DNA-binding prophage protein  26.27 
 
 		 290 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3710  hypothetical protein  23.92 
 
 		 293 aa  43.9  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  23.61 
 
 		 296 aa  43.9  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3697  hypothetical protein  27.14 
 
 		 296 aa  43.1  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.409883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>