33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3710 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3710  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  594  1e-169  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3551  putative DNA-binding prophage protein  96.59 
 
 
293 aa  570  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1364  putative DNA-binding prophage protein  72.51 
 
 
295 aa  441  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.219092  hitchhiker  0.00163149 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2096  DNA-binding prophage protein  60.21 
 
 
290 aa  360  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1655  hypothetical protein  59.23 
 
 
294 aa  350  2e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.313803  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1668  hypothetical protein  58.89 
 
 
294 aa  347  1e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.54325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2936  DNA-binding prophage protein  58.54 
 
 
291 aa  339  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000003808 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0390  hypothetical protein  51.19 
 
 
295 aa  317  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.644255 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3697  hypothetical protein  48.45 
 
 
296 aa  299  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.409883  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4062  hypothetical protein  49.83 
 
 
299 aa  297  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00820855  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0686  hypothetical protein  46.78 
 
 
295 aa  296  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4127  hypothetical protein  50.17 
 
 
295 aa  296  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2225  putative branched chain amino acid transport protein  54.9 
 
 
232 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.894087  normal  0.251816 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3746  hypothetical protein  33 
 
 
365 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.864232  normal  0.363371 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0908  hypothetical protein  41.56 
 
 
166 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0361  Phage integrase  28.26 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010858  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0312  DNA-binding prophage protein  51.79 
 
 
89 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0632325  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1415  integrase family protein  25.87 
 
 
316 aa  63.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4043  putative integrase  26.64 
 
 
287 aa  62.4  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0499  phage integrase family protein  27.09 
 
 
285 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2375  hypothetical protein  25.38 
 
 
258 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2794  phage integrase family protein  23.66 
 
 
320 aa  55.8  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0684  hypothetical protein  34.02 
 
 
240 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0833  hypothetical protein  27.17 
 
 
298 aa  52.4  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2945  phage integrase  23.68 
 
 
316 aa  48.5  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.79215e-44  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4962  hypothetical protein  24.58 
 
 
487 aa  48.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3859  putative integrase  28.78 
 
 
305 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0627  putative integrase  25.81 
 
 
288 aa  48.9  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0008  phage integrase family protein  22.4 
 
 
325 aa  47.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174514  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1176  phage integrase family protein  19.22 
 
 
349 aa  46.2  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.204113  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1553  hypothetical protein  23.92 
 
 
487 aa  43.9  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.774815 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1587  phage integrase family protein  26.58 
 
 
321 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1487  phage integrase family protein  19.29 
 
 
372 aa  42.4  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>