17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_B0008 on replicon NC_008264
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008264  CPR_B0008  phage integrase family protein  100 
 
 		 325 aa  662    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174514  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1487  phage integrase family protein  28.7 
 
 		 372 aa  142  9e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1176  phage integrase family protein  27.92 
 
 		 349 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.204113  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1415  integrase family protein  25.94 
 
 		 316 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4062  hypothetical protein  25.48 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00820855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2936  DNA-binding prophage protein  23.31 
 
 		 291 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000003808 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3710  hypothetical protein  22.4 
 
 		 293 aa  47.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2659  integrase family protein  32.63 
 
 		 531 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0390  hypothetical protein  23.28 
 
 		 295 aa  46.2  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.644255 
 
 
-
 
NC_002936  DET0323  phage integrase family site specific recombinase  26.87 
 
 		 336 aa  46.2  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.158931  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3551  putative DNA-binding prophage protein  23.92 
 
 		 293 aa  46.2  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  24.87 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  23.32 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  25.58 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0361  Phage integrase  23.74 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  21.67 
 
 		 356 aa  43.9  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  29.23 
 
 		 291 aa  43.5  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>