35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1487 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1487  phage integrase family protein  100 
 
 		 372 aa  770    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1176  phage integrase family protein  84.38 
 
 		 349 aa  609  1e-173  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.204113  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0008  phage integrase family protein  28.7 
 
 		 325 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174514  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0361  Phage integrase  29.19 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1415  integrase family protein  22.98 
 
 		 316 aa  52.8  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  27.64 
 
 		 337 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  34.07 
 
 		 381 aa  50.4  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8452  integrase family protein  26.49 
 
 		 286 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.032039  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0880  phage integrase family protein  25.99 
 
 		 291 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0027577 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1364  putative DNA-binding prophage protein  22.26 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.219092  hitchhiker  0.00163149 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  20.45 
 
 		 347 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  20.45 
 
 		 347 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5642  Phage integrase  29.81 
 
 		 403 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2872  phage integrase family protein  25.82 
 
 		 279 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000984905  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  26.62 
 
 		 283 aa  47  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5043  integrase family protein  28.32 
 
 		 160 aa  46.6  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3749  phage integrase family protein  29.05 
 
 		 318 aa  46.6  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00852374  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0938  site-specific recombinase IntI4  25.45 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827497  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3470  phage integrase family protein  35.37 
 
 		 302 aa  46.2  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0390  hypothetical protein  22.71 
 
 		 295 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.644255 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0908  hypothetical protein  27.1 
 
 		 166 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2157  phage integrase  28.04 
 
 		 363 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0421336  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2709  integrase family protein  29.93 
 
 		 210 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000251547  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  39.47 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0978  site-specific tyrosine recombinase XerS  28.12 
 
 		 356 aa  44.7  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2052  integrase family protein  41.07 
 
 		 353 aa  43.9  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00829339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  24.78 
 
 		 310 aa  43.5  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1633  phage integrase  26.98 
 
 		 362 aa  43.5  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  28.1 
 
 		 290 aa  43.1  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  28.1 
 
 		 290 aa  43.1  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2645  integron integrase  24 
 
 		 319 aa  43.1  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2242  integrase family protein  27.34 
 
 		 324 aa  42.7  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.435795  hitchhiker  0.000783825 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0037  integrase-recombinase protein  26.16 
 
 		 285 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.491877  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4062  hypothetical protein  22.14 
 
 		 299 aa  42.7  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00820855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1131  integron integrase  23.86 
 
 		 319 aa  42.7  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>