19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0908 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0908  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  330  6e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4127  hypothetical protein  45.39 
 
 		 295 aa  135  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4062  hypothetical protein  45.39 
 
 		 299 aa  132  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00820855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0390  hypothetical protein  42.76 
 
 		 295 aa  130  7.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.644255 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0686  hypothetical protein  42.58 
 
 		 295 aa  125  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1668  hypothetical protein  43.79 
 
 		 294 aa  125  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.54325 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3697  hypothetical protein  42.48 
 
 		 296 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.409883  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2936  DNA-binding prophage protein  43.14 
 
 		 291 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000003808 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1655  hypothetical protein  43.14 
 
 		 294 aa  123  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.313803  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2096  DNA-binding prophage protein  40.65 
 
 		 290 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1364  putative DNA-binding prophage protein  42.21 
 
 		 295 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.219092  hitchhiker  0.00163149 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3551  putative DNA-binding prophage protein  41.56 
 
 		 293 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3710  hypothetical protein  41.56 
 
 		 293 aa  110  8.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3746  hypothetical protein  32.21 
 
 		 365 aa  67  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.864232  normal  0.363371 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1553  hypothetical protein  29.51 
 
 		 487 aa  45.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.774815 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1487  phage integrase family protein  27.1 
 
 		 372 aa  44.7  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1176  phage integrase family protein  28.39 
 
 		 349 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.204113  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4962  hypothetical protein  29.51 
 
 		 487 aa  42.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0008  phage integrase family protein  28.95 
 
 		 325 aa  41.6  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>