27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3697 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3697  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  600  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.409883  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0686  hypothetical protein  70.31 
 
 		 295 aa  427  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0390  hypothetical protein  61.17 
 
 		 295 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.644255 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4127  hypothetical protein  59.8 
 
 		 295 aa  368  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4062  hypothetical protein  59.86 
 
 		 299 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00820855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3710  hypothetical protein  48.45 
 
 		 293 aa  299  3e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1364  putative DNA-binding prophage protein  47.77 
 
 		 295 aa  290  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.219092  hitchhiker  0.00163149 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3551  putative DNA-binding prophage protein  47.6 
 
 		 293 aa  288  5.0000000000000004e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2096  DNA-binding prophage protein  48.29 
 
 		 290 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1668  hypothetical protein  47.06 
 
 		 294 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.54325 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1655  hypothetical protein  47.06 
 
 		 294 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.313803  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2936  DNA-binding prophage protein  47.75 
 
 		 291 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000003808 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2225  putative branched chain amino acid transport protein  45.62 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.894087  normal  0.251816 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0908  hypothetical protein  42.48 
 
 		 166 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3746  hypothetical protein  29.53 
 
 		 365 aa  112  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.864232  normal  0.363371 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0684  hypothetical protein  30.53 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0312  DNA-binding prophage protein  48.28 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0632325  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0361  Phage integrase  23.69 
 
 		 318 aa  52.8  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0833  hypothetical protein  27.93 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2375  hypothetical protein  28.71 
 
 		 258 aa  48.9  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0627  putative integrase  22.81 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1415  integrase family protein  23.53 
 
 		 316 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3693  hypothetical protein  23.02 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.713079  normal  0.792602 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1587  phage integrase family protein  25.68 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0938  hypothetical protein  29.45 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.404777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1553  hypothetical protein  27.14 
 
 		 487 aa  43.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.774815 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  25.48 
 
 		 308 aa  42.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>