32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0938 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0938  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  614  1e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.404777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0746  Phage integrase  36.36 
 
 		 326 aa  175  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4936  phage integrase  35.42 
 
 		 326 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0598447  hitchhiker  0.0000000940352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0686  phage integrase  35.22 
 
 		 326 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00180883  unclonable  0.0000000000000101632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4608  phage integrase family protein  37.35 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168393 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1324  hypothetical protein  31.4 
 
 		 306 aa  155  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.12189  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1587  phage integrase family protein  34.55 
 
 		 321 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0833  hypothetical protein  29.87 
 
 		 298 aa  125  8.000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01684  hypothetical protein  28.83 
 
 		 337 aa  91.3  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6537  Fis family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 380 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2496  hypothetical protein  30.6 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2794  phage integrase family protein  25.17 
 
 		 320 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2404  hypothetical protein  29.7 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1553  hypothetical protein  33.14 
 
 		 487 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.774815 
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4043  putative integrase  29.57 
 
 		 287 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4962  hypothetical protein  34.32 
 
 		 487 aa  53.9  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0627  putative integrase  34.73 
 
 		 288 aa  53.5  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3859  putative integrase  35.88 
 
 		 305 aa  52.4  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5432  hypothetical protein  29.06 
 
 		 411 aa  50.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5579  Fis family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 376 aa  50.4  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4165  phage integrase, N-terminal SAM-like protein  31.25 
 
 		 386 aa  49.3  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.503266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6273  helix-turn-helix, Fis-type  30.17 
 
 		 384 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52320  integrase  32.56 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554417  n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2945  phage integrase  28.18 
 
 		 316 aa  47.8  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.79215e-44  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1668  hypothetical protein  28.82 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.54325 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1048  hypothetical protein  28.85 
 
 		 299 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1013  hypothetical protein  28.85 
 
 		 299 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3697  hypothetical protein  29.45 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.409883  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1655  hypothetical protein  28.82 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.313803  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4486  hypothetical protein  28.65 
 
 		 534 aa  44.3  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1415  integrase family protein  27.86 
 
 		 316 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2096  DNA-binding prophage protein  27.87 
 
 		 290 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>