31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1364 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1364  putative DNA-binding prophage protein  100 
 
 
295 aa  606  9.999999999999999e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.219092  hitchhiker  0.00163149 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3710  hypothetical protein  72.51 
 
 
293 aa  441  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3551  putative DNA-binding prophage protein  72.85 
 
 
293 aa  443  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2096  DNA-binding prophage protein  60.21 
 
 
290 aa  360  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2936  DNA-binding prophage protein  58.19 
 
 
291 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000003808 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1655  hypothetical protein  58.19 
 
 
294 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.313803  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1668  hypothetical protein  58.19 
 
 
294 aa  338  4e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.54325 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0390  hypothetical protein  48.46 
 
 
295 aa  293  3e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.644255 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0686  hypothetical protein  48.81 
 
 
295 aa  290  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3697  hypothetical protein  47.77 
 
 
296 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.409883  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4062  hypothetical protein  48.43 
 
 
299 aa  279  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00820855  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4127  hypothetical protein  48.79 
 
 
295 aa  278  6e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2225  putative branched chain amino acid transport protein  56.86 
 
 
232 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.894087  normal  0.251816 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0908  hypothetical protein  42.21 
 
 
166 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3746  hypothetical protein  31.37 
 
 
365 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.864232  normal  0.363371 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0312  DNA-binding prophage protein  53.57 
 
 
89 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0632325  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0361  Phage integrase  26 
 
 
318 aa  64.7  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010858  normal 
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4043  putative integrase  25.93 
 
 
287 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0499  phage integrase family protein  27.84 
 
 
285 aa  55.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1415  integrase family protein  26.94 
 
 
316 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0833  hypothetical protein  28.77 
 
 
298 aa  52.4  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0627  putative integrase  24.91 
 
 
288 aa  51.2  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1176  phage integrase family protein  22.64 
 
 
349 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.204113  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0684  hypothetical protein  31.63 
 
 
240 aa  50.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1487  phage integrase family protein  22.26 
 
 
372 aa  48.9  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  24.3 
 
 
308 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2375  hypothetical protein  22.48 
 
 
258 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1587  phage integrase family protein  24.74 
 
 
321 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2945  phage integrase  24.56 
 
 
316 aa  46.2  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.79215e-44  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3859  putative integrase  28.12 
 
 
305 aa  43.9  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2404  hypothetical protein  25.31 
 
 
300 aa  42.7  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>