16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3746 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3746  hypothetical protein  100 
 
 
365 aa  751    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.864232  normal  0.363371 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3710  hypothetical protein  33 
 
 
293 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1668  hypothetical protein  31.74 
 
 
294 aa  114  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.54325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2936  DNA-binding prophage protein  32.09 
 
 
291 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000003808 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1655  hypothetical protein  31.74 
 
 
294 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.313803  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3697  hypothetical protein  29.53 
 
 
296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.409883  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2096  DNA-binding prophage protein  32.08 
 
 
290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3551  putative DNA-binding prophage protein  33 
 
 
293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4062  hypothetical protein  28.85 
 
 
299 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00820855  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1364  putative DNA-binding prophage protein  31.37 
 
 
295 aa  105  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.219092  hitchhiker  0.00163149 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0686  hypothetical protein  29.66 
 
 
295 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4127  hypothetical protein  29.26 
 
 
295 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0390  hypothetical protein  27.24 
 
 
295 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.644255 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0908  hypothetical protein  32.21 
 
 
166 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2945  phage integrase  23.02 
 
 
316 aa  47.4  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.79215e-44  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1415  integrase family protein  21.83 
 
 
316 aa  46.6  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>