41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0833 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0833  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  608  1e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1587  phage integrase family protein  43.61 
 
 		 321 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01684  hypothetical protein  31.21 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0938  hypothetical protein  29.87 
 
 		 307 aa  125  8.000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.404777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1324  hypothetical protein  27.46 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.12189  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4936  phage integrase  30.32 
 
 		 326 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0598447  hitchhiker  0.0000000940352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4608  phage integrase family protein  28.79 
 
 		 326 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0746  Phage integrase  28.43 
 
 		 326 aa  94  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0686  phage integrase  30.94 
 
 		 326 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00180883  unclonable  0.0000000000000101632 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3859  putative integrase  35.11 
 
 		 305 aa  89.7  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0627  putative integrase  28.57 
 
 		 288 aa  86.7  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2496  hypothetical protein  29.83 
 
 		 298 aa  86.7  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1048  hypothetical protein  34.72 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1013  hypothetical protein  34.72 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4043  putative integrase  28.14 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2404  hypothetical protein  30.39 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4962  hypothetical protein  31.02 
 
 		 487 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1553  hypothetical protein  30.98 
 
 		 487 aa  70.1  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.774815 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52320  integrase  30.93 
 
 		 287 aa  68.9  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554417  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6537  Fis family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6273  helix-turn-helix, Fis-type  34.11 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4165  phage integrase, N-terminal SAM-like protein  28.79 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.503266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2096  DNA-binding prophage protein  30.61 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5579  Fis family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 376 aa  54.3  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3693  hypothetical protein  25.09 
 
 		 299 aa  53.1  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.713079  normal  0.792602 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2945  phage integrase  22.74 
 
 		 316 aa  52.8  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.79215e-44  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3710  hypothetical protein  27.17 
 
 		 293 aa  52.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1364  putative DNA-binding prophage protein  28.77 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.219092  hitchhiker  0.00163149 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3697  hypothetical protein  27.93 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.409883  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1655  hypothetical protein  26.27 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.313803  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5221  transcriptional regulator, Fis family  28.42 
 
 		 395 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.766336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1557  transcriptional regulator, Fis family  28.42 
 
 		 395 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0686  hypothetical protein  27.5 
 
 		 295 aa  49.7  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0361  Phage integrase  28.08 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2443  hypothetical protein  27.1 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000440238 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3551  putative DNA-binding prophage protein  26.67 
 
 		 293 aa  47.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1668  hypothetical protein  25.71 
 
 		 294 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.54325 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2531  Phage integrase, N-terminal SAM-like  24.36 
 
 		 399 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.335158 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4486  hypothetical protein  26.04 
 
 		 534 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2794  phage integrase family protein  21.48 
 
 		 320 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1415  integrase family protein  25.79 
 
 		 316 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>