29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2531 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2531  Phage integrase, N-terminal SAM-like  100 
 
 		 399 aa  813    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.335158 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2218  hypothetical protein  63.17 
 
 		 403 aa  439  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1599  hypothetical protein  57.97 
 
 		 376 aa  409  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.920348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4165  phage integrase, N-terminal SAM-like protein  41.1 
 
 		 386 aa  219  8.999999999999998e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.503266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4770  hypothetical protein  33.14 
 
 		 488 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6273  helix-turn-helix, Fis-type  34.31 
 
 		 384 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6537  Fis family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 380 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5579  Fis family transcriptional regulator  33.24 
 
 		 376 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5432  hypothetical protein  31.69 
 
 		 411 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1557  transcriptional regulator, Fis family  31.58 
 
 		 395 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5221  transcriptional regulator, Fis family  31.58 
 
 		 395 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.766336 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3693  hypothetical protein  33.82 
 
 		 299 aa  119  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.713079  normal  0.792602 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4486  hypothetical protein  27.49 
 
 		 534 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1553  hypothetical protein  26.15 
 
 		 487 aa  82  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.774815 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4962  hypothetical protein  25.54 
 
 		 487 aa  79.7  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0627  putative integrase  27.21 
 
 		 288 aa  79  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4349  phage integrase family protein  29.17 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1013  hypothetical protein  25.31 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1048  hypothetical protein  25.31 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4043  putative integrase  24.73 
 
 		 287 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2496  hypothetical protein  25.26 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1587  phage integrase family protein  28.62 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0833  hypothetical protein  24.73 
 
 		 298 aa  55.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3859  putative integrase  26.42 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52320  integrase  26.41 
 
 		 287 aa  53.5  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554417  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2404  hypothetical protein  24.91 
 
 		 300 aa  50.4  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0361  Phage integrase  25.96 
 
 		 318 aa  47.4  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0686  hypothetical protein  25.25 
 
 		 295 aa  44.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2375  hypothetical protein  23.16 
 
 		 258 aa  43.1  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>