34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5221 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1557  transcriptional regulator, Fis family  100 
 
 		 395 aa  809    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5221  transcriptional regulator, Fis family  100 
 
 		 395 aa  809    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.766336 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6273  helix-turn-helix, Fis-type  68.5 
 
 		 384 aa  520  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5579  Fis family transcriptional regulator  50.53 
 
 		 376 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6537  Fis family transcriptional regulator  49.74 
 
 		 380 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1599  hypothetical protein  33.77 
 
 		 376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.920348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4165  phage integrase, N-terminal SAM-like protein  32.37 
 
 		 386 aa  124  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.503266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5432  hypothetical protein  31.69 
 
 		 411 aa  123  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2531  Phage integrase, N-terminal SAM-like  31.35 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.335158 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2218  hypothetical protein  33.33 
 
 		 403 aa  120  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4770  hypothetical protein  28.86 
 
 		 488 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1553  hypothetical protein  33.03 
 
 		 487 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.774815 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4962  hypothetical protein  30.82 
 
 		 487 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4043  putative integrase  29.76 
 
 		 287 aa  103  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4486  hypothetical protein  32.33 
 
 		 534 aa  91.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52320  integrase  32.44 
 
 		 287 aa  90.9  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554417  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0627  putative integrase  29.19 
 
 		 288 aa  86.3  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4349  phage integrase family protein  27.88 
 
 		 429 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3693  hypothetical protein  27.61 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.713079  normal  0.792602 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3859  putative integrase  27.85 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1587  phage integrase family protein  29.22 
 
 		 321 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0833  hypothetical protein  28.42 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1048  hypothetical protein  25.9 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1013  hypothetical protein  25.9 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2496  hypothetical protein  26.42 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2404  hypothetical protein  24.48 
 
 		 300 aa  54.7  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1324  hypothetical protein  29.27 
 
 		 306 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.12189  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0361  Phage integrase  28.93 
 
 		 318 aa  52.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4936  phage integrase  29.71 
 
 		 326 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0598447  hitchhiker  0.0000000940352 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2375  hypothetical protein  28.19 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3743  hypothetical protein  32.88 
 
 		 162 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.786232 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2794  phage integrase family protein  27.96 
 
 		 320 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1176  phage integrase family protein  27.59 
 
 		 349 aa  43.9  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.204113  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1415  integrase family protein  28.71 
 
 		 316 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>