33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4165 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4165  phage integrase, N-terminal SAM-like protein  100 
 
 		 386 aa  799    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.503266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2531  Phage integrase, N-terminal SAM-like  41.1 
 
 		 399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.335158 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1599  hypothetical protein  39.43 
 
 		 376 aa  202  8e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.920348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2218  hypothetical protein  39.05 
 
 		 403 aa  193  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5579  Fis family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 376 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4770  hypothetical protein  29.76 
 
 		 488 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6273  helix-turn-helix, Fis-type  31.29 
 
 		 384 aa  129  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6537  Fis family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 380 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5432  hypothetical protein  31.1 
 
 		 411 aa  126  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5221  transcriptional regulator, Fis family  31.05 
 
 		 395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.766336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1557  transcriptional regulator, Fis family  31.05 
 
 		 395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3693  hypothetical protein  28.36 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.713079  normal  0.792602 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4962  hypothetical protein  33.68 
 
 		 487 aa  94.7  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1553  hypothetical protein  30.96 
 
 		 487 aa  94.7  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.774815 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4486  hypothetical protein  28.81 
 
 		 534 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0627  putative integrase  29.64 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4349  phage integrase family protein  27.67 
 
 		 429 aa  84.7  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4043  putative integrase  28.57 
 
 		 287 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52320  integrase  28.25 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554417  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2496  hypothetical protein  26.81 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2404  hypothetical protein  26.24 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3859  putative integrase  26.33 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4936  phage integrase  30.41 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0598447  hitchhiker  0.0000000940352 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1013  hypothetical protein  24.82 
 
 		 299 aa  62.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1048  hypothetical protein  24.82 
 
 		 299 aa  62.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0686  phage integrase  28.97 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00180883  unclonable  0.0000000000000101632 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1587  phage integrase family protein  27.89 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0833  hypothetical protein  28.79 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4608  phage integrase family protein  27.53 
 
 		 326 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168393 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1324  hypothetical protein  29.65 
 
 		 306 aa  52.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.12189  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0746  Phage integrase  29.67 
 
 		 326 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0938  hypothetical protein  31.25 
 
 		 307 aa  49.7  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.404777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0686  hypothetical protein  24.81 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>