40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2496 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006369  lpl2496  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  620  1e-177  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2404  hypothetical protein  66.56 
 
 		 300 aa  417  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1048  hypothetical protein  63.18 
 
 		 299 aa  397  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1013  hypothetical protein  63.18 
 
 		 299 aa  397  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0627  putative integrase  39.86 
 
 		 288 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52320  integrase  40.69 
 
 		 287 aa  189  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554417  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4043  putative integrase  36.52 
 
 		 287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3859  putative integrase  38.04 
 
 		 305 aa  169  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1553  hypothetical protein  29.49 
 
 		 487 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.774815 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1587  phage integrase family protein  31.54 
 
 		 321 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4962  hypothetical protein  28.91 
 
 		 487 aa  97.8  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0833  hypothetical protein  29.83 
 
 		 298 aa  86.7  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5579  Fis family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 376 aa  86.3  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6537  Fis family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3693  hypothetical protein  26.03 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.713079  normal  0.792602 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1599  hypothetical protein  25.4 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.920348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4165  phage integrase, N-terminal SAM-like protein  26.81 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.503266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4770  hypothetical protein  27.07 
 
 		 488 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4349  phage integrase family protein  26.28 
 
 		 429 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01684  hypothetical protein  27.46 
 
 		 337 aa  67  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2403  hypothetical protein  25.32 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1324  hypothetical protein  27.35 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.12189  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0938  hypothetical protein  30.6 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.404777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5221  transcriptional regulator, Fis family  26.42 
 
 		 395 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.766336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1557  transcriptional regulator, Fis family  26.42 
 
 		 395 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2531  Phage integrase, N-terminal SAM-like  24.56 
 
 		 399 aa  55.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.335158 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2218  hypothetical protein  24.37 
 
 		 403 aa  55.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0746  Phage integrase  27.34 
 
 		 326 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6273  helix-turn-helix, Fis-type  25.36 
 
 		 384 aa  53.5  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0361  Phage integrase  21.96 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2945  phage integrase  23.98 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.79215e-44  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4608  phage integrase family protein  35 
 
 		 326 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168393 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1049  hypothetical protein  27.27 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2495  hypothetical protein  21.7 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1014  hypothetical protein  24.87 
 
 		 268 aa  47.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0686  phage integrase  33.33 
 
 		 326 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00180883  unclonable  0.0000000000000101632 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1074  hypothetical protein  22.22 
 
 		 269 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2375  hypothetical protein  24.38 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0390  hypothetical protein  24.29 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.644255 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4936  phage integrase  36.11 
 
 		 326 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0598447  hitchhiker  0.0000000940352 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>