26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1599 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1599  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  763    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.920348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2218  hypothetical protein  66.4 
 
 		 403 aa  480  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2531  Phage integrase, N-terminal SAM-like  57.97 
 
 		 399 aa  399  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.335158 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4165  phage integrase, N-terminal SAM-like protein  39.43 
 
 		 386 aa  202  8e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.503266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4770  hypothetical protein  31.79 
 
 		 488 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5579  Fis family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 376 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6273  helix-turn-helix, Fis-type  33.11 
 
 		 384 aa  129  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1557  transcriptional regulator, Fis family  33.77 
 
 		 395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5221  transcriptional regulator, Fis family  33.77 
 
 		 395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.766336 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5432  hypothetical protein  29.79 
 
 		 411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6537  Fis family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 380 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3693  hypothetical protein  30.07 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.713079  normal  0.792602 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4349  phage integrase family protein  28.81 
 
 		 429 aa  94.4  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0627  putative integrase  28.2 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4962  hypothetical protein  26.49 
 
 		 487 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1553  hypothetical protein  28.57 
 
 		 487 aa  79.7  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.774815 
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4043  putative integrase  28.25 
 
 		 287 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1048  hypothetical protein  26.38 
 
 		 299 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1013  hypothetical protein  26.38 
 
 		 299 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4486  hypothetical protein  29.57 
 
 		 534 aa  77  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2496  hypothetical protein  25.4 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52320  integrase  27.48 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554417  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3859  putative integrase  26.56 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2404  hypothetical protein  23.7 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2375  hypothetical protein  25.26 
 
 		 258 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1587  phage integrase family protein  25.85 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>