15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2403 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2403  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  560  1e-158  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2495  hypothetical protein  42.54 
 
 
269 aa  216  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1014  hypothetical protein  40.3 
 
 
268 aa  202  6e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1074  hypothetical protein  40.37 
 
 
269 aa  194  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1049  hypothetical protein  39.55 
 
 
268 aa  192  7e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4043  putative integrase  26.72 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0627  putative integrase  25.52 
 
 
288 aa  68.9  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2404  hypothetical protein  24.7 
 
 
300 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2496  hypothetical protein  25.32 
 
 
298 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3859  putative integrase  24.28 
 
 
305 aa  62.8  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1048  hypothetical protein  22.86 
 
 
299 aa  56.6  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1013  hypothetical protein  22.86 
 
 
299 aa  56.6  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52320  integrase  25 
 
 
287 aa  55.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554417  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3693  hypothetical protein  22.77 
 
 
299 aa  51.6  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.713079  normal  0.792602 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4962  hypothetical protein  25.15 
 
 
487 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.160649 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>