15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1015 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1015  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  667    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0906431  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2116  hypothetical protein  45.03 
 
 
322 aa  268  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3695  hypothetical protein  42.63 
 
 
311 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.483298  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0964  hypothetical protein  32.62 
 
 
343 aa  159  4e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0950  hypothetical protein  35.02 
 
 
313 aa  159  5e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.785839  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0856  hypothetical protein  33.78 
 
 
321 aa  99  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1424  hypothetical protein  29.63 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0941  hypothetical protein  34.44 
 
 
192 aa  79  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.421958  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1431  phage integrase family protein  30.39 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0361  Phage integrase  23.81 
 
 
318 aa  54.7  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010858  normal 
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1356  hypothetical protein  38.36 
 
 
76 aa  53.9  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.527083  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0686  phage integrase family protein  33.68 
 
 
295 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1415  integrase family protein  21.72 
 
 
316 aa  50.1  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2945  phage integrase  22.3 
 
 
316 aa  47.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.79215e-44  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53570  putative integrase  28.83 
 
 
258 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000326616  decreased coverage  0.0000890956 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>