14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2116 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2116  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  664    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3695  hypothetical protein  47.81 
 
 		 311 aa  294  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.483298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1015  hypothetical protein  45.03 
 
 		 322 aa  268  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0906431  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0964  hypothetical protein  31.52 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0950  hypothetical protein  30.98 
 
 		 313 aa  142  5e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.785839  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0856  hypothetical protein  29.57 
 
 		 321 aa  98.6  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1424  hypothetical protein  28.08 
 
 		 321 aa  85.9  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0686  phage integrase family protein  31.38 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1431  phage integrase family protein  31.25 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0941  hypothetical protein  26.03 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.421958  n/a   
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1356  hypothetical protein  41.1 
 
 		 76 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.527083  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1415  integrase family protein  22.58 
 
 		 316 aa  49.7  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2945  phage integrase  23.17 
 
 		 316 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.79215e-44  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0361  Phage integrase  21.38 
 
 		 318 aa  43.1  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010858  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>