75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0295 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0295  integrase domain protein SAM domain protein  100 
 
 		 347 aa  712    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.891563  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1403  integrase family protein  41.83 
 
 		 335 aa  261  1e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1699  phage integrase/site-specific recombinase  40.35 
 
 		 345 aa  239  5.999999999999999e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.440946  normal  0.508848 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0155  integrase-like protein  40.52 
 
 		 349 aa  238  9e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.650609 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0110  integrase family protein  38.26 
 
 		 338 aa  218  2e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0965  integrase family protein  38.26 
 
 		 351 aa  205  7e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0782339 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0789  integrase domain protein SAM domain protein  36.49 
 
 		 351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0467  integrase domain protein SAM domain protein  34.99 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.486802 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0442  integrase family protein  34.87 
 
 		 340 aa  172  6.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.966823 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1644  integrase family protein  34.68 
 
 		 333 aa  169  5e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.104877 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2751  integrase family protein  33.62 
 
 		 368 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0353  integrase family protein  32.54 
 
 		 401 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  23.32 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.16 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  23.08 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  28.66 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  23.71 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  26.19 
 
 		 297 aa  55.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0358  integrase family protein  25.61 
 
 		 287 aa  55.1  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  19.82 
 
 		 296 aa  53.1  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  30.61 
 
 		 309 aa  52.8  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  24.85 
 
 		 294 aa  52.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  21.05 
 
 		 299 aa  49.7  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  28.48 
 
 		 295 aa  49.3  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.88 
 
 		 299 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.87 
 
 		 299 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.88 
 
 		 299 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.88 
 
 		 299 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.88 
 
 		 299 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.87 
 
 		 299 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  21.19 
 
 		 309 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  18.5 
 
 		 294 aa  47.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0264  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.05 
 
 		 315 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  26.44 
 
 		 306 aa  47.4  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  20.53 
 
 		 299 aa  47  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.59 
 
 		 299 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1283  site-specific tyrosine recombinase XerD  20.23 
 
 		 297 aa  47.4  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  21.19 
 
 		 309 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.59 
 
 		 299 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0292  tyrosine recombinase XerD  22.92 
 
 		 305 aa  47  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  26.35 
 
 		 296 aa  46.6  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0611  integrase family protein  19.77 
 
 		 337 aa  46.2  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.35 
 
 		 299 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  26.35 
 
 		 299 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  23.32 
 
 		 299 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  22.95 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.85 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3133  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.82 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2996  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.82 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0374572 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.59 
 
 		 299 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0861  site-specific tyrosine recombinase XerD  20.49 
 
 		 299 aa  45.8  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  21.73 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  27.14 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  25.9 
 
 		 313 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  27.88 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  20.99 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1698  integrase family protein  21.43 
 
 		 314 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3115  phage integrase  28.49 
 
 		 298 aa  44.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  31.02 
 
 		 332 aa  44.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  23.32 
 
 		 318 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0036  integrase family protein  20.66 
 
 		 324 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.95657  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  20.12 
 
 		 308 aa  43.5  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  20 
 
 		 295 aa  43.5  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.12 
 
 		 301 aa  43.1  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0163  integrase family protein  27.22 
 
 		 342 aa  43.1  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.70922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4805  tyrosine recombinase XerC  28.57 
 
 		 367 aa  43.1  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104736  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0730  phage integrase  19.53 
 
 		 305 aa  43.1  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0928  integrase family protein  27.81 
 
 		 326 aa  42.7  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.669409 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0229  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  26.7 
 
 		 362 aa  43.1  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0950  integrase/recombinase XerD  26.45 
 
 		 300 aa  42.7  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3189  integrase family protein  33.71 
 
 		 320 aa  42.7  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0247  integrase family protein  27.04 
 
 		 322 aa  42.7  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121071  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0039  tyrosine recombinase XerD  27.71 
 
 		 312 aa  42.7  0.01  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2809  phage integrase family protein  26.28 
 
 		 311 aa  42.7  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47730  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.92 
 
 		 299 aa  42.7  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>