197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1124 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1124  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain-containing protein  100 
 
 		 386 aa  785    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2216  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  77.28 
 
 		 387 aa  632  1e-180  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.166546  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1140  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain-containing protein  77.08 
 
 		 391 aa  624  1e-178  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.944509 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0481  Galactarate dehydratase  62.69 
 
 		 385 aa  501  1e-141  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1012  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  63.9 
 
 		 390 aa  493  9.999999999999999e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.551016 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2462  Altronate dehydratase  62.34 
 
 		 392 aa  486  1e-136  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2590  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like protein  59.43 
 
 		 384 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0469328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2051  Altronate dehydratase  57.81 
 
 		 384 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000291794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4418  Altronate dehydratase  55.61 
 
 		 384 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3819  Altronate dehydratase  56.99 
 
 		 391 aa  434  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.257566  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2156  Altronate dehydratase  56.81 
 
 		 386 aa  431  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0892  Altronate dehydratase  56.48 
 
 		 408 aa  434  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6087  Altronate dehydratase  56.48 
 
 		 391 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2375  Altronate dehydratase  55.84 
 
 		 386 aa  426  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.602236  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3529  Altronate dehydratase  55.96 
 
 		 391 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1766  Altronate dehydratase  57.25 
 
 		 389 aa  422  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0211518  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2005  Altronate dehydratase  55.32 
 
 		 387 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2003  Altronate dehydratase  55.32 
 
 		 387 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3706  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  55.56 
 
 		 426 aa  423  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5979  Altronate dehydratase  55.67 
 
 		 426 aa  422  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.25481 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2038  putative altronate hydrolase  54.38 
 
 		 393 aa  424  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.624711  normal  0.146869 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2324  Altronate dehydratase  55.87 
 
 		 387 aa  404  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0207  Altronate dehydratase  43.27 
 
 		 390 aa  288  8e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0126  Altronate dehydratase  41.58 
 
 		 389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6357  Altronate dehydratase  38.64 
 
 		 384 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.194037  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3804  Altronate dehydratase  36.9 
 
 		 384 aa  251  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5298  Altronate dehydratase  37.08 
 
 		 384 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0693  hydrolase, UxaA family  36.55 
 
 		 388 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0782051  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0753  UxaA family hydrolase  36.55 
 
 		 408 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.371457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0767  UxaA family hydrolase  36.55 
 
 		 388 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0810  UxaA family hydrolase  36.55 
 
 		 388 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.107485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0707  UxaA family hydrolase  36.55 
 
 		 408 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250621  normal  0.872847 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4456  Altronate dehydratase  40.1 
 
 		 395 aa  245  9e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.0000308674  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3275  Altronate dehydratase  37.14 
 
 		 385 aa  242  9e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.549273  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1064  altronate hydrolase  34.26 
 
 		 505 aa  227  3e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.343724  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1451  altronate hydrolase  33.85 
 
 		 388 aa  218  1e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6467  Altronate dehydratase  31.06 
 
 		 507 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457294  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6702  Altronate dehydratase  31.06 
 
 		 507 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07160  altronate dehydratase  32.09 
 
 		 508 aa  176  7e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0589773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3855  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain-containing protein  33.68 
 
 		 393 aa  176  8e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00201653  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6308  Altronate dehydratase  30.81 
 
 		 507 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1602  galactarate dehydratase  31.25 
 
 		 513 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6583  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  30.45 
 
 		 517 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0600477  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1221  Altronate dehydratase  31.06 
 
 		 507 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1027  galactarate dehydratase  31.28 
 
 		 509 aa  172  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1247  Altronate dehydratase  30.81 
 
 		 507 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.665181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0800  Altronate dehydratase  30.95 
 
 		 512 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6599  galactarate dehydratase  29.95 
 
 		 516 aa  170  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5478  Altronate dehydratase  30.05 
 
 		 508 aa  169  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4671  Altronate dehydratase  29.93 
 
 		 523 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3970  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like  28.82 
 
 		 509 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05270  altronate dehydratase  29.82 
 
 		 525 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2834  UxaA family hydrolase  30.77 
 
 		 513 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0582  Altronate dehydratase  30.1 
 
 		 533 aa  163  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5155  Altronate dehydratase  30.52 
 
 		 515 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1749  Altronate dehydratase  30.05 
 
 		 510 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548358  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0264  Altronate dehydratase  28.12 
 
 		 500 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.530336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2740  Altronate dehydratase  31.15 
 
 		 493 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000642568  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2068  Altronate dehydratase  31.17 
 
 		 511 aa  162  7e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0287  Altronate dehydratase  27.87 
 
 		 500 aa  162  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2948  galactarate dehydratase  30.52 
 
 		 513 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2855  Altronate dehydratase  30.77 
 
 		 513 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4262  galactarate dehydratase  29.82 
 
 		 507 aa  162  9e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.892671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1610  altronate hydrolase  27.87 
 
 		 500 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4019  Altronate dehydratase  32.88 
 
 		 552 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1575  Altronate dehydratase  31.55 
 
 		 498 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3059  galactarate dehydratase  29.78 
 
 		 507 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3799  Altronate dehydratase  30.05 
 
 		 526 aa  160  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1862  galactarate dehydratase  29.43 
 
 		 538 aa  160  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2533  Galactarate dehydratase  29.01 
 
 		 533 aa  160  4e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0179  galactarate dehydratase  29.75 
 
 		 507 aa  159  9e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2945  putative D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase  29.6 
 
 		 507 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0792126  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1545  Altronate dehydratase  30.58 
 
 		 403 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1702  Altronate dehydratase  30 
 
 		 508 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0806  UxaA family hydrolase  29.9 
 
 		 514 aa  157  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.941516  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0724  Altronate dehydratase  28.78 
 
 		 515 aa  157  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3043  Altronate dehydratase  29.72 
 
 		 500 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.551416  normal  0.217859 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4448  Altronate dehydratase  29.65 
 
 		 508 aa  156  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3225  Altronate dehydratase  28.28 
 
 		 501 aa  155  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0756  UxaA family hydrolase  29.9 
 
 		 514 aa  155  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0783  Galactarate dehydratase  28.57 
 
 		 508 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0495  Altronate dehydratase  28.22 
 
 		 509 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0691  Altronate dehydratase  28.21 
 
 		 496 aa  153  5e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0955  glycogen debranching protein GlgX  27.68 
 
 		 508 aa  153  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00705486  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6828  Altronate dehydratase  31.36 
 
 		 548 aa  153  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.779291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1952  Galactarate dehydratase  28.93 
 
 		 507 aa  153  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5792  Altronate dehydratase  28.71 
 
 		 523 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5795  Altronate dehydratase  28.47 
 
 		 523 aa  152  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228862  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2430  Altronate dehydratase  31.2 
 
 		 402 aa  152  7e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3904  galactarate dehydratase  29.47 
 
 		 514 aa  152  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0590  Galactarate dehydratase  30.6 
 
 		 512 aa  152  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.413028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6103  D-galactarate dehydratase  28.68 
 
 		 510 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3967  Altronate dehydratase  28.82 
 
 		 508 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.816529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0228  D-altronate dehydratase  29.57 
 
 		 503 aa  150  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1537  Altronate dehydratase  28.57 
 
 		 513 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.281722 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6916  Altronate dehydratase  30.14 
 
 		 439 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  normal  0.499575 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2960  Altronate dehydratase  29.9 
 
 		 450 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3512  D-altronate dehydratase  31.54 
 
 		 507 aa  149  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1615  putative altronate hydrolase (ALTRONIC acid hydratase) protein  28.4 
 
 		 519 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135092  normal  0.0340906 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2347  galactarate dehydratase  28.64 
 
 		 509 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>