234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_A0756 on replicon NC_009504
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1602  galactarate dehydratase  68.62 
 
 
513 aa  717    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0806  UxaA family hydrolase  99.42 
 
 
514 aa  1049    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.941516  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3970  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like  64.88 
 
 
509 aa  665    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4671  Altronate dehydratase  69.47 
 
 
523 aa  732    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6103  D-galactarate dehydratase  62.7 
 
 
510 aa  666    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0756  UxaA family hydrolase  100 
 
 
514 aa  1056    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3904  galactarate dehydratase  90.47 
 
 
514 aa  971    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1537  Altronate dehydratase  56.45 
 
 
513 aa  582  1.0000000000000001e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.281722 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0582  Altronate dehydratase  55.34 
 
 
533 aa  579  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0783  Galactarate dehydratase  56.89 
 
 
508 aa  575  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3967  Altronate dehydratase  55.91 
 
 
508 aa  567  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.816529  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1027  galactarate dehydratase  55.03 
 
 
509 aa  560  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4928  galactarate dehydratase  55.01 
 
 
508 aa  559  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1862  galactarate dehydratase  56.52 
 
 
538 aa  558  1e-158  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3059  galactarate dehydratase  57 
 
 
507 aa  556  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364841  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2855  Altronate dehydratase  54.16 
 
 
513 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547251  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5155  Altronate dehydratase  55.36 
 
 
515 aa  553  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1749  Altronate dehydratase  56.63 
 
 
510 aa  550  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548358  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6583  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  53.56 
 
 
517 aa  548  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0600477  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2834  UxaA family hydrolase  53.58 
 
 
513 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4278  Altronate dehydratase  54.08 
 
 
507 aa  546  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569461  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4448  Altronate dehydratase  54.04 
 
 
508 aa  547  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5792  Altronate dehydratase  54.4 
 
 
523 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5795  Altronate dehydratase  54.44 
 
 
523 aa  547  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228862  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2068  Altronate dehydratase  57.79 
 
 
511 aa  546  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186874  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2948  galactarate dehydratase  53.77 
 
 
513 aa  548  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439252  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0955  glycogen debranching protein GlgX  52.55 
 
 
508 aa  542  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00705486  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0179  galactarate dehydratase  54.98 
 
 
507 aa  543  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6599  galactarate dehydratase  53.75 
 
 
516 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2945  putative D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase  54.99 
 
 
507 aa  539  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0792126  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05270  altronate dehydratase  54.29 
 
 
525 aa  536  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1952  Galactarate dehydratase  51.89 
 
 
507 aa  535  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2347  galactarate dehydratase  52.99 
 
 
509 aa  531  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3576  Altronate dehydratase  52.08 
 
 
510 aa  534  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5478  Altronate dehydratase  53.07 
 
 
508 aa  531  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767398  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3898  uronate isomerase  52.98 
 
 
510 aa  530  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.90307  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2082  galactarate dehydratase  52.67 
 
 
509 aa  526  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.315134  normal  0.334548 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4262  galactarate dehydratase  51.99 
 
 
507 aa  524  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.892671  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1615  putative altronate hydrolase (ALTRONIC acid hydratase) protein  50.69 
 
 
519 aa  520  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135092  normal  0.0340906 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6308  Altronate dehydratase  53.35 
 
 
507 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6467  Altronate dehydratase  53.07 
 
 
507 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457294  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1221  Altronate dehydratase  52.38 
 
 
507 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6702  Altronate dehydratase  53.07 
 
 
507 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0590  Galactarate dehydratase  54.78 
 
 
512 aa  515  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.413028  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1247  Altronate dehydratase  51.98 
 
 
507 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.665181  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0724  Altronate dehydratase  49.11 
 
 
515 aa  512  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1702  Altronate dehydratase  51 
 
 
508 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3225  Altronate dehydratase  52.88 
 
 
501 aa  504  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0495  Altronate dehydratase  49.41 
 
 
509 aa  504  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2533  Galactarate dehydratase  51.68 
 
 
533 aa  499  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07160  altronate dehydratase  50.79 
 
 
508 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0589773  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1610  altronate hydrolase  51.2 
 
 
500 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0264  Altronate dehydratase  50.9 
 
 
500 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.530336  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0287  Altronate dehydratase  49.71 
 
 
500 aa  475  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0154  Altronate dehydratase  51.5 
 
 
500 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0475003  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0160  Galactarate dehydratase  51.3 
 
 
500 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00621613  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3799  Altronate dehydratase  44.23 
 
 
526 aa  445  1.0000000000000001e-124  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3442  galactarate dehydratase  39.52 
 
 
523 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3513  galactarate dehydratase  39.52 
 
 
523 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3550  galactarate dehydratase  39.52 
 
 
523 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0864027  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3444  galactarate dehydratase  39.52 
 
 
523 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343558  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1754  Altronate dehydratase  39.2 
 
 
514 aa  310  4e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4684  galactarate dehydratase  39.06 
 
 
516 aa  310  5e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.360454  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3608  galactarate dehydratase  38.99 
 
 
523 aa  309  6.999999999999999e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3318  galactarate dehydratase  38.99 
 
 
523 aa  309  9e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02993  (D)-galactarate dehydrogenase  38.99 
 
 
523 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4442  galactarate dehydratase  38.66 
 
 
523 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.648393 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0572  galactarate dehydratase  38.99 
 
 
523 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02944  hypothetical protein  38.99 
 
 
523 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0577  galactarate dehydratase  38.99 
 
 
523 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3425  galactarate dehydratase  38.99 
 
 
523 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0806  galactarate dehydratase  38.37 
 
 
524 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1064  altronate hydrolase  37.29 
 
 
505 aa  307  4.0000000000000004e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.343724  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3265  galactarate dehydratase  38.83 
 
 
530 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.133789 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0840  galactarate dehydratase  38.29 
 
 
524 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3398  galactarate dehydratase  37.76 
 
 
524 aa  301  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6490  (D)-galactarate dehydrogenase  37.42 
 
 
513 aa  301  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3570  galactarate dehydratase  38.57 
 
 
523 aa  300  5e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.631935 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3558  galactarate dehydratase  37.55 
 
 
524 aa  299  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0691  Altronate dehydratase  34.94 
 
 
496 aa  298  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4320  Altronate dehydratase  36.02 
 
 
496 aa  297  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1778  galactarate dehydratase  38.37 
 
 
534 aa  293  4e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479447  normal  0.643906 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3527  altronate dehydratase  36.35 
 
 
495 aa  293  5e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3383  altronate dehydratase  36.35 
 
 
495 aa  293  6e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3559  altronate dehydratase  36.35 
 
 
495 aa  292  8e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02960  altronate hydrolase  36.35 
 
 
495 aa  290  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3274  altronate dehydratase  36.35 
 
 
495 aa  290  3e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0609  Altronate dehydratase  36.35 
 
 
495 aa  290  3e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4406  altronate dehydratase  36.35 
 
 
495 aa  290  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.731196 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02911  hypothetical protein  36.35 
 
 
495 aa  290  3e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0610  Altronate dehydratase  36.14 
 
 
495 aa  289  6e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0228  D-altronate dehydratase  38.87 
 
 
503 aa  289  9e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0800  Altronate dehydratase  35.03 
 
 
512 aa  287  4e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2484  galactarate dehydratase  35.77 
 
 
533 aa  286  5.999999999999999e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000132334 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1998  galactarate dehydratase  35.47 
 
 
520 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.257982  normal  0.434412 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0531  Altronate dehydratase  35.08 
 
 
496 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1575  Altronate dehydratase  37.35 
 
 
498 aa  284  3.0000000000000004e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1597  galactarate dehydratase  35.18 
 
 
532 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1218  galactarate dehydratase  37.65 
 
 
518 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0502126  normal  0.0293032 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3545  D-altronate dehydratase  35.32 
 
 
495 aa  283  5.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.444536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>