236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6467 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6308  Altronate dehydratase  98.03 
 
 		 507 aa  995    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1247  Altronate dehydratase  73.23 
 
 		 507 aa  730    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.665181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6467  Altronate dehydratase  100 
 
 		 507 aa  1016    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457294  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1221  Altronate dehydratase  73.62 
 
 		 507 aa  734    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6702  Altronate dehydratase  100 
 
 		 507 aa  1016    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5478  Altronate dehydratase  72.05 
 
 		 508 aa  726    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2068  Altronate dehydratase  63.1 
 
 		 511 aa  607  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1602  galactarate dehydratase  55.05 
 
 		 513 aa  558  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0582  Altronate dehydratase  56.07 
 
 		 533 aa  551  1e-156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3967  Altronate dehydratase  55.6 
 
 		 508 aa  549  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.816529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0783  Galactarate dehydratase  55.27 
 
 		 508 aa  546  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5155  Altronate dehydratase  56.14 
 
 		 515 aa  545  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1862  galactarate dehydratase  57.17 
 
 		 538 aa  546  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4671  Altronate dehydratase  53.57 
 
 		 523 aa  544  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5795  Altronate dehydratase  53.36 
 
 		 523 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228862  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4262  galactarate dehydratase  54.9 
 
 		 507 aa  535  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.892671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6583  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  54.79 
 
 		 517 aa  533  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0600477  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3970  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like  53.69 
 
 		 509 aa  532  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5792  Altronate dehydratase  52.96 
 
 		 523 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1537  Altronate dehydratase  54.04 
 
 		 513 aa  531  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.281722 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2834  UxaA family hydrolase  53.8 
 
 		 513 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3576  Altronate dehydratase  53.1 
 
 		 510 aa  528  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4448  Altronate dehydratase  54.62 
 
 		 508 aa  527  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2855  Altronate dehydratase  54.19 
 
 		 513 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547251  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0806  UxaA family hydrolase  53.68 
 
 		 514 aa  522  1e-147  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.941516  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4278  Altronate dehydratase  52.95 
 
 		 507 aa  525  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569461  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1027  galactarate dehydratase  52.76 
 
 		 509 aa  524  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4928  galactarate dehydratase  54.51 
 
 		 508 aa  522  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6599  galactarate dehydratase  56.07 
 
 		 516 aa  520  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0756  UxaA family hydrolase  53.28 
 
 		 514 aa  518  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3904  galactarate dehydratase  52.66 
 
 		 514 aa  520  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07160  altronate dehydratase  55.05 
 
 		 508 aa  517  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0589773  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1615  putative altronate hydrolase (ALTRONIC acid hydratase) protein  53.08 
 
 		 519 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135092  normal  0.0340906 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0955  glycogen debranching protein GlgX  52.67 
 
 		 508 aa  516  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00705486  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2948  galactarate dehydratase  53.22 
 
 		 513 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2945  putative D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase  53.02 
 
 		 507 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0792126  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2082  galactarate dehydratase  54.42 
 
 		 509 aa  514  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.315134  normal  0.334548 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2347  galactarate dehydratase  52.56 
 
 		 509 aa  508  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0179  galactarate dehydratase  53.03 
 
 		 507 aa  510  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1610  altronate hydrolase  52.08 
 
 		 500 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3225  Altronate dehydratase  53.25 
 
 		 501 aa  511  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1952  Galactarate dehydratase  52.26 
 
 		 507 aa  506  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0264  Altronate dehydratase  51.78 
 
 		 500 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.530336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3059  galactarate dehydratase  53.29 
 
 		 507 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0287  Altronate dehydratase  52.37 
 
 		 500 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0724  Altronate dehydratase  50.4 
 
 		 515 aa  502  1e-141  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05270  altronate dehydratase  52.3 
 
 		 525 aa  497  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1702  Altronate dehydratase  51.07 
 
 		 508 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6103  D-galactarate dehydratase  50 
 
 		 510 aa  492  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1749  Altronate dehydratase  52.57 
 
 		 510 aa  492  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548358  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0495  Altronate dehydratase  50.89 
 
 		 509 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0590  Galactarate dehydratase  53.48 
 
 		 512 aa  487  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.413028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0160  Galactarate dehydratase  51.28 
 
 		 500 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00621613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0154  Altronate dehydratase  51.08 
 
 		 500 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0475003  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3799  Altronate dehydratase  48.29 
 
 		 526 aa  470  1.0000000000000001e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3898  uronate isomerase  49.12 
 
 		 510 aa  466  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.90307  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2533  Galactarate dehydratase  49.16 
 
 		 533 aa  457  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1754  Altronate dehydratase  42.86 
 
 		 514 aa  345  1e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4684  galactarate dehydratase  42.28 
 
 		 516 aa  331  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.360454  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1064  altronate hydrolase  36.8 
 
 		 505 aa  328  2.0000000000000001e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.343724  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1575  Altronate dehydratase  41.88 
 
 		 498 aa  325  1e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0228  D-altronate dehydratase  42.66 
 
 		 503 aa  325  2e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0800  Altronate dehydratase  37.84 
 
 		 512 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1218  galactarate dehydratase  40 
 
 		 518 aa  320  6e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0502126  normal  0.0293032 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0830  D-galactarate dehydratase  39.03 
 
 		 533 aa  317  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0806  galactarate dehydratase  38.35 
 
 		 524 aa  317  3e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0840  galactarate dehydratase  37.9 
 
 		 524 aa  317  3e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05250  D-galactarate dehydratase  40.78 
 
 		 517 aa  316  6e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3043  Altronate dehydratase  41.37 
 
 		 500 aa  315  9.999999999999999e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.551416  normal  0.217859 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3265  galactarate dehydratase  41.62 
 
 		 530 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.133789 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3512  D-altronate dehydratase  41.18 
 
 		 507 aa  314  1.9999999999999998e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4448  galactarate dehydratase  37.6 
 
 		 533 aa  310  4e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0860733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4582  galactarate dehydratase  37.6 
 
 		 533 aa  310  4e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.699937  normal  0.473159 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2740  Altronate dehydratase  35.45 
 
 		 493 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000642568  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3104  galactarate dehydratase  37.79 
 
 		 548 aa  307  3e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4547  D-galactarate dehydratase  38.99 
 
 		 517 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.457968  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0830  galactarate dehydratase  39.25 
 
 		 517 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.15069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3398  galactarate dehydratase  36.95 
 
 		 524 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2484  galactarate dehydratase  37.7 
 
 		 533 aa  306  6e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000132334 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3558  galactarate dehydratase  36.55 
 
 		 524 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0190  D-galactarate dehydratase  38.55 
 
 		 564 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1597  galactarate dehydratase  37.35 
 
 		 532 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0207  Altronate dehydratase  42.13 
 
 		 390 aa  303  4.0000000000000003e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1778  galactarate dehydratase  39.96 
 
 		 534 aa  302  9e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479447  normal  0.643906 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4225  galactarate dehydratase  38.29 
 
 		 517 aa  302  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3690  galactarate dehydratase  37.33 
 
 		 524 aa  301  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6490  (D)-galactarate dehydrogenase  38.63 
 
 		 513 aa  300  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2315  galactarate dehydratase  38.33 
 
 		 517 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.761535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0691  Altronate dehydratase  34.48 
 
 		 496 aa  298  1e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3100  galactarate dehydratase  38.38 
 
 		 517 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4865  galactarate dehydratase  35.99 
 
 		 529 aa  298  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0784645  normal  0.0391217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2816  galactarate dehydratase  38.24 
 
 		 517 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0628742  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3601  D-galactarate dehydratase, putative  37.67 
 
 		 517 aa  296  8e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.271934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1161  Altronate dehydratase  35.48 
 
 		 550 aa  295  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2595  galactarate dehydratase  38.43 
 
 		 518 aa  295  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.865762  normal  0.097428 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3509  Altronate dehydratase  36.97 
 
 		 496 aa  294  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4320  Altronate dehydratase  37.65 
 
 		 496 aa  293  4e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4734  galactarate dehydratase  36.25 
 
 		 530 aa  293  5e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.481286  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3409  galactarate dehydratase  38 
 
 		 518 aa  293  5e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.219407  normal  0.594385 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4675  galactarate dehydratase  38.2 
 
 		 517 aa  292  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.654315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>