238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0287 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1610  altronate hydrolase  96 
 
 		 500 aa  988    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0264  Altronate dehydratase  96 
 
 		 500 aa  988    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.530336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0287  Altronate dehydratase  100 
 
 		 500 aa  1019    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3225  Altronate dehydratase  59.84 
 
 		 501 aa  588  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0154  Altronate dehydratase  59.88 
 
 		 500 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0475003  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0160  Galactarate dehydratase  59.56 
 
 		 500 aa  570  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00621613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0179  galactarate dehydratase  56.13 
 
 		 507 aa  536  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6583  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  53.63 
 
 		 517 aa  519  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0600477  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1602  galactarate dehydratase  51.38 
 
 		 513 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6308  Altronate dehydratase  52.65 
 
 		 507 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6467  Altronate dehydratase  52.37 
 
 		 507 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457294  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6702  Altronate dehydratase  52.37 
 
 		 507 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4671  Altronate dehydratase  52.36 
 
 		 523 aa  507  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1702  Altronate dehydratase  52.17 
 
 		 508 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0582  Altronate dehydratase  51.03 
 
 		 533 aa  507  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0783  Galactarate dehydratase  51.49 
 
 		 508 aa  503  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6599  galactarate dehydratase  52.98 
 
 		 516 aa  501  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5478  Altronate dehydratase  50.78 
 
 		 508 aa  499  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1749  Altronate dehydratase  50.69 
 
 		 510 aa  500  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548358  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5792  Altronate dehydratase  51.08 
 
 		 523 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2948  galactarate dehydratase  52.38 
 
 		 513 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3898  uronate isomerase  51.69 
 
 		 510 aa  495  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.90307  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2834  UxaA family hydrolase  51.68 
 
 		 513 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3967  Altronate dehydratase  50.5 
 
 		 508 aa  495  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.816529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4928  galactarate dehydratase  52.4 
 
 		 508 aa  498  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5795  Altronate dehydratase  50.89 
 
 		 523 aa  497  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228862  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4448  Altronate dehydratase  50.59 
 
 		 508 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1247  Altronate dehydratase  51.12 
 
 		 507 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.665181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1221  Altronate dehydratase  51.33 
 
 		 507 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1862  galactarate dehydratase  51.98 
 
 		 538 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2855  Altronate dehydratase  51.68 
 
 		 513 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1027  galactarate dehydratase  49.2 
 
 		 509 aa  489  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3059  galactarate dehydratase  50.5 
 
 		 507 aa  487  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3970  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like  51 
 
 		 509 aa  487  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07160  altronate dehydratase  51.19 
 
 		 508 aa  487  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0589773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1537  Altronate dehydratase  50.6 
 
 		 513 aa  486  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.281722 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0955  glycogen debranching protein GlgX  49.31 
 
 		 508 aa  484  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00705486  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2068  Altronate dehydratase  51.19 
 
 		 511 aa  482  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186874  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0806  UxaA family hydrolase  50.7 
 
 		 514 aa  478  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.941516  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6103  D-galactarate dehydratase  49.31 
 
 		 510 aa  479  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5155  Altronate dehydratase  50.98 
 
 		 515 aa  480  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05270  altronate dehydratase  50.51 
 
 		 525 aa  474  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4262  galactarate dehydratase  49.5 
 
 		 507 aa  472  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.892671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2945  putative D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase  49.11 
 
 		 507 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0792126  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0756  UxaA family hydrolase  50.6 
 
 		 514 aa  474  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3904  galactarate dehydratase  48.82 
 
 		 514 aa  472  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0590  Galactarate dehydratase  52.49 
 
 		 512 aa  468  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.413028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2082  galactarate dehydratase  50.3 
 
 		 509 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.315134  normal  0.334548 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2347  galactarate dehydratase  49.21 
 
 		 509 aa  466  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4278  Altronate dehydratase  49 
 
 		 507 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569461  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3799  Altronate dehydratase  45.83 
 
 		 526 aa  468  9.999999999999999e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1615  putative altronate hydrolase (ALTRONIC acid hydratase) protein  48.5 
 
 		 519 aa  456  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135092  normal  0.0340906 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1952  Galactarate dehydratase  48.5 
 
 		 507 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3576  Altronate dehydratase  47.49 
 
 		 510 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0724  Altronate dehydratase  47.2 
 
 		 515 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0495  Altronate dehydratase  45.45 
 
 		 509 aa  449  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2533  Galactarate dehydratase  47.55 
 
 		 533 aa  443  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1754  Altronate dehydratase  43.11 
 
 		 514 aa  336  5e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1218  galactarate dehydratase  39.32 
 
 		 518 aa  332  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0502126  normal  0.0293032 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1575  Altronate dehydratase  41.06 
 
 		 498 aa  325  1e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0800  Altronate dehydratase  38.55 
 
 		 512 aa  324  3e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0228  D-altronate dehydratase  41.63 
 
 		 503 aa  321  1.9999999999999998e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2740  Altronate dehydratase  36.18 
 
 		 493 aa  309  9e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000642568  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4684  galactarate dehydratase  39.31 
 
 		 516 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.360454  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3265  galactarate dehydratase  39.29 
 
 		 530 aa  307  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.133789 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05250  D-galactarate dehydratase  38.12 
 
 		 517 aa  305  9.000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1064  altronate hydrolase  35.27 
 
 		 505 aa  305  2.0000000000000002e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.343724  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3512  D-altronate dehydratase  40.12 
 
 		 507 aa  304  2.0000000000000002e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3043  Altronate dehydratase  41 
 
 		 500 aa  303  7.000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.551416  normal  0.217859 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0840  galactarate dehydratase  37.18 
 
 		 524 aa  301  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0748  Altronate dehydratase  35.5 
 
 		 496 aa  300  3e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1778  galactarate dehydratase  38.96 
 
 		 534 aa  300  4e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479447  normal  0.643906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6490  (D)-galactarate dehydrogenase  36.62 
 
 		 513 aa  300  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0806  galactarate dehydratase  36.85 
 
 		 524 aa  300  6e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3383  Altronate dehydratase  35.5 
 
 		 496 aa  299  7e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4547  D-galactarate dehydratase  36.09 
 
 		 517 aa  299  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.457968  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3509  Altronate dehydratase  35.5 
 
 		 496 aa  299  1e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0830  galactarate dehydratase  37.94 
 
 		 517 aa  298  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.15069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3318  galactarate dehydratase  36.27 
 
 		 523 aa  297  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3608  galactarate dehydratase  36.27 
 
 		 523 aa  296  4e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02993  (D)-galactarate dehydrogenase  36.27 
 
 		 523 aa  296  5e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0577  galactarate dehydratase  36.27 
 
 		 523 aa  296  5e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4320  Altronate dehydratase  36.74 
 
 		 496 aa  296  5e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02944  hypothetical protein  36.27 
 
 		 523 aa  296  5e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0493  altronate dehydratase  35.77 
 
 		 496 aa  296  5e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0830  D-galactarate dehydratase  37.85 
 
 		 533 aa  296  6e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0531  Altronate dehydratase  35.31 
 
 		 496 aa  296  6e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3425  galactarate dehydratase  36.27 
 
 		 523 aa  296  7e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0572  galactarate dehydratase  36.27 
 
 		 523 aa  296  9e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0691  Altronate dehydratase  34.12 
 
 		 496 aa  295  9e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4225  galactarate dehydratase  36.35 
 
 		 517 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4442  galactarate dehydratase  36.27 
 
 		 523 aa  295  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.648393 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1102  altronate hydrolase  35.57 
 
 		 496 aa  294  2e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3104  galactarate dehydratase  36.76 
 
 		 548 aa  293  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1597  galactarate dehydratase  36.24 
 
 		 532 aa  293  6e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0556  Altronate dehydratase  35.57 
 
 		 496 aa  292  7e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.370951  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4675  galactarate dehydratase  37.33 
 
 		 517 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.654315 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3545  D-altronate dehydratase  35.11 
 
 		 495 aa  291  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3100  galactarate dehydratase  37.23 
 
 		 517 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6828  Altronate dehydratase  34.48 
 
 		 548 aa  290  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.779291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>