236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3383 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02960  altronate hydrolase  79.88 
 
 		 495 aa  826    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0610  Altronate dehydratase  79.88 
 
 		 495 aa  825    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0691  Altronate dehydratase  60.36 
 
 		 496 aa  642    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02911  hypothetical protein  79.88 
 
 		 495 aa  826    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0531  Altronate dehydratase  88.91 
 
 		 496 aa  923    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1102  altronate hydrolase  84.88 
 
 		 496 aa  880    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3383  altronate dehydratase  79.88 
 
 		 495 aa  825    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4320  Altronate dehydratase  84.27 
 
 		 496 aa  875    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0493  altronate dehydratase  85.08 
 
 		 496 aa  884    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0556  Altronate dehydratase  84.88 
 
 		 496 aa  880    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.370951  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3527  altronate dehydratase  79.67 
 
 		 495 aa  826    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0609  Altronate dehydratase  79.88 
 
 		 495 aa  826    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3559  altronate dehydratase  80.08 
 
 		 495 aa  828    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0748  Altronate dehydratase  88.91 
 
 		 496 aa  926    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3509  Altronate dehydratase  90.93 
 
 		 496 aa  943    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3545  D-altronate dehydratase  80.28 
 
 		 495 aa  825    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3383  Altronate dehydratase  100 
 
 		 496 aa  1028    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3274  altronate dehydratase  79.88 
 
 		 495 aa  826    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4406  altronate dehydratase  79.88 
 
 		 495 aa  826    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.731196 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2740  Altronate dehydratase  52.52 
 
 		 493 aa  553  1e-156  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000642568  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1754  Altronate dehydratase  50.82 
 
 		 514 aa  493  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0800  Altronate dehydratase  48.49 
 
 		 512 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1575  Altronate dehydratase  49.7 
 
 		 498 aa  491  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3043  Altronate dehydratase  49.4 
 
 		 500 aa  473  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.551416  normal  0.217859 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0228  D-altronate dehydratase  48.58 
 
 		 503 aa  438  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3512  D-altronate dehydratase  46.23 
 
 		 507 aa  434  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1610  altronate hydrolase  36.69 
 
 		 500 aa  309  9e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0264  Altronate dehydratase  36.49 
 
 		 500 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.530336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0582  Altronate dehydratase  38.12 
 
 		 533 aa  301  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0287  Altronate dehydratase  35.5 
 
 		 500 aa  299  7e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0955  glycogen debranching protein GlgX  35.64 
 
 		 508 aa  293  3e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00705486  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6828  Altronate dehydratase  35.22 
 
 		 548 aa  293  5e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.779291 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1749  Altronate dehydratase  35.57 
 
 		 510 aa  290  6e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548358  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1064  altronate hydrolase  34.78 
 
 		 505 aa  284  3.0000000000000004e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.343724  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0590  Galactarate dehydratase  36.96 
 
 		 512 aa  284  3.0000000000000004e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.413028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3898  uronate isomerase  36.18 
 
 		 510 aa  283  4.0000000000000003e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.90307  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3799  Altronate dehydratase  35.14 
 
 		 526 aa  283  4.0000000000000003e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07160  altronate dehydratase  36.46 
 
 		 508 aa  282  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0589773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6308  Altronate dehydratase  35.35 
 
 		 507 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0806  UxaA family hydrolase  34.87 
 
 		 514 aa  281  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.941516  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6467  Altronate dehydratase  35.35 
 
 		 507 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457294  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6702  Altronate dehydratase  35.35 
 
 		 507 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3225  Altronate dehydratase  35.83 
 
 		 501 aa  280  4e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1735  Altronate dehydratase  34.51 
 
 		 546 aa  280  5e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.969827  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0756  UxaA family hydrolase  34.87 
 
 		 514 aa  280  6e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4448  Altronate dehydratase  33.88 
 
 		 508 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5478  Altronate dehydratase  33.73 
 
 		 508 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2068  Altronate dehydratase  35.86 
 
 		 511 aa  278  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6103  D-galactarate dehydratase  33.13 
 
 		 510 aa  277  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2945  putative D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase  35.87 
 
 		 507 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0792126  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05270  altronate dehydratase  35.86 
 
 		 525 aa  274  3e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3970  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like  34.76 
 
 		 509 aa  271  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0179  galactarate dehydratase  32.92 
 
 		 507 aa  269  7e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2948  galactarate dehydratase  34.27 
 
 		 513 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3904  galactarate dehydratase  33.33 
 
 		 514 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2855  Altronate dehydratase  34.01 
 
 		 513 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1221  Altronate dehydratase  33.47 
 
 		 507 aa  266  8e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2834  UxaA family hydrolase  33.81 
 
 		 513 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1247  Altronate dehydratase  33.54 
 
 		 507 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.665181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4258  Altronate dehydratase  32.28 
 
 		 540 aa  265  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.350711  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6583  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  34.15 
 
 		 517 aa  265  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0600477  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1537  Altronate dehydratase  33.79 
 
 		 513 aa  264  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.281722 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5503  Altronate dehydratase  31.82 
 
 		 554 aa  264  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031137 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4785  Altronate dehydratase  33.46 
 
 		 551 aa  263  6.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4928  galactarate dehydratase  32.93 
 
 		 508 aa  263  8e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1702  Altronate dehydratase  32.03 
 
 		 508 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2533  Galactarate dehydratase  34.44 
 
 		 533 aa  262  1e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5792  Altronate dehydratase  32.59 
 
 		 523 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1027  galactarate dehydratase  32.66 
 
 		 509 aa  260  4e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6599  galactarate dehydratase  35.37 
 
 		 516 aa  259  7e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1862  galactarate dehydratase  32.92 
 
 		 538 aa  258  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0783  Galactarate dehydratase  32.67 
 
 		 508 aa  258  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3967  Altronate dehydratase  32.87 
 
 		 508 aa  257  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.816529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1161  Altronate dehydratase  31.35 
 
 		 550 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5795  Altronate dehydratase  32.34 
 
 		 523 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228862  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1602  galactarate dehydratase  32.2 
 
 		 513 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5155  Altronate dehydratase  32.35 
 
 		 515 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0416  Altronate dehydratase  31.66 
 
 		 582 aa  253  5.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.9023 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5737  Altronate dehydratase  31.63 
 
 		 551 aa  252  9.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10366 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3059  galactarate dehydratase  33.66 
 
 		 507 aa  252  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0154  Altronate dehydratase  34.46 
 
 		 500 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0475003  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0160  Galactarate dehydratase  34.4 
 
 		 500 aa  250  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00621613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4671  Altronate dehydratase  31.73 
 
 		 523 aa  249  7e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1615  putative altronate hydrolase (ALTRONIC acid hydratase) protein  31.98 
 
 		 519 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135092  normal  0.0340906 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4278  Altronate dehydratase  32.12 
 
 		 507 aa  246  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569461  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0724  Altronate dehydratase  32.72 
 
 		 515 aa  245  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4019  Altronate dehydratase  30.92 
 
 		 552 aa  244  3e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1451  altronate hydrolase  33.84 
 
 		 388 aa  244  3e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4262  galactarate dehydratase  33.06 
 
 		 507 aa  242  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.892671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0207  Altronate dehydratase  35.92 
 
 		 390 aa  236  5.0000000000000005e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2347  galactarate dehydratase  31.85 
 
 		 509 aa  236  7e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3576  Altronate dehydratase  31.76 
 
 		 510 aa  233  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0495  Altronate dehydratase  31.65 
 
 		 509 aa  233  8.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1952  Galactarate dehydratase  31.77 
 
 		 507 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2082  galactarate dehydratase  32.52 
 
 		 509 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.315134  normal  0.334548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6490  (D)-galactarate dehydrogenase  32.66 
 
 		 513 aa  222  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0830  galactarate dehydratase  33.84 
 
 		 517 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.15069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3275  Altronate dehydratase  34.53 
 
 		 385 aa  221  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.549273  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4547  D-galactarate dehydratase  32.08 
 
 		 517 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.457968  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0190  D-galactarate dehydratase  30.99 
 
 		 564 aa  218  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>