197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3275 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3275  Altronate dehydratase  100 
 
 		 385 aa  777    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.549273  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0767  UxaA family hydrolase  59.58 
 
 		 388 aa  474  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0753  UxaA family hydrolase  59.58 
 
 		 408 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.371457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0707  UxaA family hydrolase  59.58 
 
 		 408 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250621  normal  0.872847 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0693  hydrolase, UxaA family  59.58 
 
 		 388 aa  474  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0782051  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0810  UxaA family hydrolase  59.58 
 
 		 388 aa  474  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.107485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0207  Altronate dehydratase  54.95 
 
 		 390 aa  404  1e-111  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0126  Altronate dehydratase  52.23 
 
 		 389 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1064  altronate hydrolase  46.7 
 
 		 505 aa  365  1e-100  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.343724  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1451  altronate hydrolase  46.61 
 
 		 388 aa  353  2.9999999999999997e-96  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4456  Altronate dehydratase  49.35 
 
 		 395 aa  330  3e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.0000308674  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3804  Altronate dehydratase  42.22 
 
 		 384 aa  292  6e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6357  Altronate dehydratase  41.95 
 
 		 384 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.194037  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0179  galactarate dehydratase  43.18 
 
 		 507 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0582  Altronate dehydratase  40.91 
 
 		 533 aa  280  4e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2051  Altronate dehydratase  40.73 
 
 		 384 aa  278  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000291794  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3059  galactarate dehydratase  40.75 
 
 		 507 aa  273  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07160  altronate dehydratase  42.78 
 
 		 508 aa  273  3e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0589773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5298  Altronate dehydratase  39.58 
 
 		 384 aa  272  8.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2945  putative D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase  40.65 
 
 		 507 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0792126  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0481  Galactarate dehydratase  37.63 
 
 		 385 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4418  Altronate dehydratase  39.43 
 
 		 384 aa  268  8e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2590  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like protein  39.18 
 
 		 384 aa  268  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0469328  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6467  Altronate dehydratase  39.95 
 
 		 507 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457294  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6702  Altronate dehydratase  39.95 
 
 		 507 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3970  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like  39.95 
 
 		 509 aa  265  7e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5979  Altronate dehydratase  40.43 
 
 		 426 aa  264  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.25481 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6308  Altronate dehydratase  39.43 
 
 		 507 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4671  Altronate dehydratase  38.94 
 
 		 523 aa  263  3e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2462  Altronate dehydratase  40.26 
 
 		 392 aa  262  8.999999999999999e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4448  Altronate dehydratase  38.75 
 
 		 508 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2068  Altronate dehydratase  41 
 
 		 511 aa  259  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3967  Altronate dehydratase  39.15 
 
 		 508 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.816529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3799  Altronate dehydratase  37.96 
 
 		 526 aa  259  5.0000000000000005e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6583  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  40.15 
 
 		 517 aa  259  6e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0600477  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6103  D-galactarate dehydratase  39.45 
 
 		 510 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0955  glycogen debranching protein GlgX  38.73 
 
 		 508 aa  258  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00705486  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3706  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  39.36 
 
 		 426 aa  258  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3819  Altronate dehydratase  38.26 
 
 		 391 aa  257  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.257566  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5478  Altronate dehydratase  39.07 
 
 		 508 aa  257  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6599  galactarate dehydratase  39.39 
 
 		 516 aa  256  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1862  galactarate dehydratase  40.76 
 
 		 538 aa  255  9e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1537  Altronate dehydratase  38.75 
 
 		 513 aa  255  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.281722 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6087  Altronate dehydratase  38.06 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1602  galactarate dehydratase  39.14 
 
 		 513 aa  253  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05270  altronate dehydratase  39.59 
 
 		 525 aa  252  6e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2038  putative altronate hydrolase  39.53 
 
 		 393 aa  252  6e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.624711  normal  0.146869 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0892  Altronate dehydratase  37.2 
 
 		 408 aa  251  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3225  Altronate dehydratase  39.9 
 
 		 501 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0806  UxaA family hydrolase  38.35 
 
 		 514 aa  251  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.941516  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3904  galactarate dehydratase  38.35 
 
 		 514 aa  251  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3529  Altronate dehydratase  38.06 
 
 		 391 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2003  Altronate dehydratase  38.26 
 
 		 387 aa  250  4e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0756  UxaA family hydrolase  38.35 
 
 		 514 aa  249  4e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2005  Altronate dehydratase  38.26 
 
 		 387 aa  250  4e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4262  galactarate dehydratase  39.24 
 
 		 507 aa  249  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.892671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1247  Altronate dehydratase  38.99 
 
 		 507 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.665181  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1615  putative altronate hydrolase (ALTRONIC acid hydratase) protein  38.83 
 
 		 519 aa  248  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135092  normal  0.0340906 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1221  Altronate dehydratase  39.39 
 
 		 507 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4278  Altronate dehydratase  38.38 
 
 		 507 aa  247  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569461  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5795  Altronate dehydratase  38.44 
 
 		 523 aa  246  6e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228862  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2430  Altronate dehydratase  40.77 
 
 		 402 aa  245  8e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3898  uronate isomerase  40 
 
 		 510 aa  245  9e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.90307  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1012  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  37.92 
 
 		 390 aa  245  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.551016 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3576  Altronate dehydratase  38.64 
 
 		 510 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2834  UxaA family hydrolase  38.75 
 
 		 513 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1749  Altronate dehydratase  37.75 
 
 		 510 aa  244  3e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548358  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4928  galactarate dehydratase  38.15 
 
 		 508 aa  244  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2375  Altronate dehydratase  37.2 
 
 		 386 aa  243  5e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.602236  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1140  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain-containing protein  38.73 
 
 		 391 aa  243  5e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.944509 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1702  Altronate dehydratase  37.11 
 
 		 508 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5792  Altronate dehydratase  38.19 
 
 		 523 aa  242  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2855  Altronate dehydratase  38.6 
 
 		 513 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547251  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2216  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  37.7 
 
 		 387 aa  242  7.999999999999999e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.166546  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1124  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain-containing protein  37.14 
 
 		 386 aa  242  9e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2948  galactarate dehydratase  37.69 
 
 		 513 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0783  Galactarate dehydratase  37.68 
 
 		 508 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2533  Galactarate dehydratase  38.21 
 
 		 533 aa  241  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2324  Altronate dehydratase  37.73 
 
 		 387 aa  238  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1766  Altronate dehydratase  37.27 
 
 		 389 aa  238  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0211518  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0287  Altronate dehydratase  36.36 
 
 		 500 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0264  Altronate dehydratase  36.36 
 
 		 500 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.530336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0590  Galactarate dehydratase  39.8 
 
 		 512 aa  236  7e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.413028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2082  galactarate dehydratase  38.83 
 
 		 509 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.315134  normal  0.334548 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1575  Altronate dehydratase  36.66 
 
 		 498 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0724  Altronate dehydratase  37.28 
 
 		 515 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2156  Altronate dehydratase  36.29 
 
 		 386 aa  233  3e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5155  Altronate dehydratase  36.79 
 
 		 515 aa  234  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2740  Altronate dehydratase  33.67 
 
 		 493 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000642568  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1610  altronate hydrolase  35.86 
 
 		 500 aa  233  5e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1027  galactarate dehydratase  36.48 
 
 		 509 aa  231  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1952  Galactarate dehydratase  36.11 
 
 		 507 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1102  altronate hydrolase  35.29 
 
 		 496 aa  231  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0495  Altronate dehydratase  38.58 
 
 		 509 aa  231  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0493  altronate dehydratase  35.29 
 
 		 496 aa  230  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0556  Altronate dehydratase  35.29 
 
 		 496 aa  230  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.370951  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3509  Altronate dehydratase  35.04 
 
 		 496 aa  230  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2960  Altronate dehydratase  38.1 
 
 		 450 aa  229  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4298  Altronate dehydratase  37.19 
 
 		 435 aa  229  9e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.968705 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0825  putative D-galactarate dehydratase/altronate dehydratase  37.34 
 
 		 440 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>