241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3512 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3512  D-altronate dehydratase  100 
 
 		 507 aa  996    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3043  Altronate dehydratase  60.04 
 
 		 500 aa  544  1e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.551416  normal  0.217859 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1754  Altronate dehydratase  57.58 
 
 		 514 aa  536  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0800  Altronate dehydratase  51.99 
 
 		 512 aa  512  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0228  D-altronate dehydratase  53.61 
 
 		 503 aa  471  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1575  Altronate dehydratase  50.6 
 
 		 498 aa  453  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0748  Altronate dehydratase  46.92 
 
 		 496 aa  449  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4320  Altronate dehydratase  47.71 
 
 		 496 aa  450  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2740  Altronate dehydratase  45.02 
 
 		 493 aa  451  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000642568  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0531  Altronate dehydratase  47.52 
 
 		 496 aa  451  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3383  altronate dehydratase  47.59 
 
 		 495 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02960  altronate hydrolase  47.19 
 
 		 495 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3559  altronate dehydratase  47.39 
 
 		 495 aa  444  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4406  altronate dehydratase  47.19 
 
 		 495 aa  442  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.731196 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3274  altronate dehydratase  47.19 
 
 		 495 aa  442  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02911  hypothetical protein  47.19 
 
 		 495 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3509  Altronate dehydratase  47.12 
 
 		 496 aa  442  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0609  Altronate dehydratase  47.19 
 
 		 495 aa  442  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0610  Altronate dehydratase  47.19 
 
 		 495 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3527  altronate dehydratase  46.99 
 
 		 495 aa  441  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3383  Altronate dehydratase  46.64 
 
 		 496 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3545  D-altronate dehydratase  46.49 
 
 		 495 aa  432  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0691  Altronate dehydratase  43.94 
 
 		 496 aa  426  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0493  altronate dehydratase  45.73 
 
 		 496 aa  424  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0556  Altronate dehydratase  45.53 
 
 		 496 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.370951  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1102  altronate hydrolase  45.53 
 
 		 496 aa  422  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6308  Altronate dehydratase  41.18 
 
 		 507 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6467  Altronate dehydratase  41.18 
 
 		 507 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457294  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6702  Altronate dehydratase  41.18 
 
 		 507 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1247  Altronate dehydratase  40.28 
 
 		 507 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.665181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0287  Altronate dehydratase  40.9 
 
 		 500 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1221  Altronate dehydratase  40.08 
 
 		 507 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1610  altronate hydrolase  40.19 
 
 		 500 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5478  Altronate dehydratase  40.31 
 
 		 508 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3225  Altronate dehydratase  41.92 
 
 		 501 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0264  Altronate dehydratase  40.12 
 
 		 500 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.530336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07160  altronate dehydratase  40.92 
 
 		 508 aa  311  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0589773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5155  Altronate dehydratase  39.33 
 
 		 515 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2948  galactarate dehydratase  40.08 
 
 		 513 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1602  galactarate dehydratase  39.23 
 
 		 513 aa  307  3e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2834  UxaA family hydrolase  39.49 
 
 		 513 aa  306  7e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3059  galactarate dehydratase  40.28 
 
 		 507 aa  306  8.000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2855  Altronate dehydratase  39.49 
 
 		 513 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4448  Altronate dehydratase  38.88 
 
 		 508 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4671  Altronate dehydratase  38.11 
 
 		 523 aa  304  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3970  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like  37.23 
 
 		 509 aa  302  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2945  putative D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase  40.24 
 
 		 507 aa  301  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0792126  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5792  Altronate dehydratase  39.81 
 
 		 523 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5795  Altronate dehydratase  38.69 
 
 		 523 aa  297  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228862  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0416  Altronate dehydratase  35.89 
 
 		 582 aa  296  7e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.9023 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1749  Altronate dehydratase  38.66 
 
 		 510 aa  295  1e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548358  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4785  Altronate dehydratase  36.56 
 
 		 551 aa  294  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2068  Altronate dehydratase  39.53 
 
 		 511 aa  293  5e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0582  Altronate dehydratase  40.35 
 
 		 533 aa  293  6e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1537  Altronate dehydratase  38.34 
 
 		 513 aa  292  9e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.281722 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1064  altronate hydrolase  35.29 
 
 		 505 aa  292  1e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.343724  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3799  Altronate dehydratase  37.89 
 
 		 526 aa  292  1e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4928  galactarate dehydratase  37.38 
 
 		 508 aa  291  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1862  galactarate dehydratase  38.64 
 
 		 538 aa  291  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0783  Galactarate dehydratase  37.96 
 
 		 508 aa  290  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1027  galactarate dehydratase  37.13 
 
 		 509 aa  289  7e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0590  Galactarate dehydratase  40.85 
 
 		 512 aa  288  1e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.413028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6583  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  38.07 
 
 		 517 aa  286  7e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0600477  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3967  Altronate dehydratase  38.46 
 
 		 508 aa  286  9e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.816529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6599  galactarate dehydratase  39.66 
 
 		 516 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1702  Altronate dehydratase  37.68 
 
 		 508 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0756  UxaA family hydrolase  36.38 
 
 		 514 aa  283  4.0000000000000003e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2533  Galactarate dehydratase  40.43 
 
 		 533 aa  282  1e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0806  UxaA family hydrolase  36.38 
 
 		 514 aa  282  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.941516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5737  Altronate dehydratase  35.43 
 
 		 551 aa  282  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10366 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0955  glycogen debranching protein GlgX  37.06 
 
 		 508 aa  282  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00705486  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05270  altronate dehydratase  38.25 
 
 		 525 aa  282  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3904  galactarate dehydratase  35.81 
 
 		 514 aa  281  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1735  Altronate dehydratase  37.66 
 
 		 546 aa  281  3e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.969827  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6828  Altronate dehydratase  34.95 
 
 		 548 aa  280  4e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.779291 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0160  Galactarate dehydratase  39.13 
 
 		 500 aa  280  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00621613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0154  Altronate dehydratase  38.72 
 
 		 500 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0475003  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3898  uronate isomerase  37.25 
 
 		 510 aa  276  8e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.90307  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4258  Altronate dehydratase  34.77 
 
 		 540 aa  273  7e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.350711  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1161  Altronate dehydratase  34.37 
 
 		 550 aa  272  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1615  putative altronate hydrolase (ALTRONIC acid hydratase) protein  36.54 
 
 		 519 aa  271  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135092  normal  0.0340906 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2082  galactarate dehydratase  37.96 
 
 		 509 aa  271  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.315134  normal  0.334548 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0179  galactarate dehydratase  36.89 
 
 		 507 aa  270  4e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4262  galactarate dehydratase  37.94 
 
 		 507 aa  267  4e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.892671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6103  D-galactarate dehydratase  36.35 
 
 		 510 aa  265  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4019  Altronate dehydratase  34.06 
 
 		 552 aa  263  6.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0724  Altronate dehydratase  35.25 
 
 		 515 aa  262  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3576  Altronate dehydratase  38.39 
 
 		 510 aa  261  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0495  Altronate dehydratase  35.31 
 
 		 509 aa  260  4e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1952  Galactarate dehydratase  37.8 
 
 		 507 aa  259  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5503  Altronate dehydratase  33.75 
 
 		 554 aa  254  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031137 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2347  galactarate dehydratase  36.42 
 
 		 509 aa  254  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0207  Altronate dehydratase  39.21 
 
 		 390 aa  253  7e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4278  Altronate dehydratase  35.64 
 
 		 507 aa  252  9.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569461  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0126  Altronate dehydratase  35.71 
 
 		 389 aa  247  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1451  altronate hydrolase  36.25 
 
 		 388 aa  228  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3275  Altronate dehydratase  37.91 
 
 		 385 aa  220  5e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.549273  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0693  hydrolase, UxaA family  34.6 
 
 		 388 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0782051  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0810  UxaA family hydrolase  34.6 
 
 		 388 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.107485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0707  UxaA family hydrolase  34.6 
 
 		 408 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250621  normal  0.872847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>