197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B0693 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0707  UxaA family hydrolase  100 
 
 
408 aa  796    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250621  normal  0.872847 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0767  UxaA family hydrolase  100 
 
 
388 aa  796    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0753  UxaA family hydrolase  99.74 
 
 
408 aa  794    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.371457  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0693  hydrolase, UxaA family  100 
 
 
388 aa  796    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0782051  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0810  UxaA family hydrolase  100 
 
 
388 aa  796    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.107485  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3275  Altronate dehydratase  59.58 
 
 
385 aa  474  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.549273  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0207  Altronate dehydratase  51.29 
 
 
390 aa  395  1e-109  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0126  Altronate dehydratase  51.33 
 
 
389 aa  386  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1064  altronate hydrolase  46.68 
 
 
505 aa  360  2e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.343724  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4456  Altronate dehydratase  48.06 
 
 
395 aa  335  7e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.0000308674  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1451  altronate hydrolase  42.89 
 
 
388 aa  328  7e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3804  Altronate dehydratase  42.15 
 
 
384 aa  302  6.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3059  galactarate dehydratase  43.18 
 
 
507 aa  295  9e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364841  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4418  Altronate dehydratase  39.53 
 
 
384 aa  288  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2051  Altronate dehydratase  39.79 
 
 
384 aa  280  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000291794  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0481  Galactarate dehydratase  39.58 
 
 
385 aa  279  5e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2590  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like protein  38.7 
 
 
384 aa  279  6e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0469328  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5298  Altronate dehydratase  40.16 
 
 
384 aa  276  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07160  altronate dehydratase  41.97 
 
 
508 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0589773  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6357  Altronate dehydratase  39.9 
 
 
384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.194037  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3799  Altronate dehydratase  38.78 
 
 
526 aa  270  2.9999999999999997e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2005  Altronate dehydratase  39.49 
 
 
387 aa  270  4e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2003  Altronate dehydratase  39.49 
 
 
387 aa  270  4e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0179  galactarate dehydratase  40.81 
 
 
507 aa  268  8.999999999999999e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2945  putative D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase  39.6 
 
 
507 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0792126  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3225  Altronate dehydratase  39.01 
 
 
501 aa  267  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3819  Altronate dehydratase  38.6 
 
 
391 aa  267  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.257566  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6599  galactarate dehydratase  40.25 
 
 
516 aa  266  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6308  Altronate dehydratase  38.52 
 
 
507 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6583  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  39.5 
 
 
517 aa  265  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0600477  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6467  Altronate dehydratase  38.52 
 
 
507 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457294  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6702  Altronate dehydratase  38.52 
 
 
507 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4928  galactarate dehydratase  39.8 
 
 
508 aa  265  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5979  Altronate dehydratase  39.32 
 
 
426 aa  263  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.25481 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2068  Altronate dehydratase  39.39 
 
 
511 aa  263  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186874  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1862  galactarate dehydratase  41.09 
 
 
538 aa  263  3e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0892  Altronate dehydratase  38.54 
 
 
408 aa  263  4e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0582  Altronate dehydratase  39.3 
 
 
533 aa  263  4e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2375  Altronate dehydratase  38.46 
 
 
386 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.602236  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2462  Altronate dehydratase  38.48 
 
 
392 aa  261  1e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3898  uronate isomerase  40.94 
 
 
510 aa  260  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.90307  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1602  galactarate dehydratase  38.4 
 
 
513 aa  261  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2038  putative altronate hydrolase  39.28 
 
 
393 aa  261  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.624711  normal  0.146869 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05270  altronate dehydratase  39.45 
 
 
525 aa  260  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2324  Altronate dehydratase  39.12 
 
 
387 aa  259  4e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3529  Altronate dehydratase  38.86 
 
 
391 aa  259  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1537  Altronate dehydratase  37.5 
 
 
513 aa  259  8e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.281722 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0955  glycogen debranching protein GlgX  38.29 
 
 
508 aa  258  9e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00705486  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1749  Altronate dehydratase  38.23 
 
 
510 aa  258  9e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548358  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5792  Altronate dehydratase  39.65 
 
 
523 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3706  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  38.6 
 
 
426 aa  257  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0783  Galactarate dehydratase  38.25 
 
 
508 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3970  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like  37.19 
 
 
509 aa  256  6e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6087  Altronate dehydratase  37.82 
 
 
391 aa  255  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4278  Altronate dehydratase  38.13 
 
 
507 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569461  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2156  Altronate dehydratase  38.34 
 
 
386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5795  Altronate dehydratase  38.65 
 
 
523 aa  253  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228862  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2533  Galactarate dehydratase  38 
 
 
533 aa  253  3e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1766  Altronate dehydratase  38.66 
 
 
389 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0211518  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3967  Altronate dehydratase  36.75 
 
 
508 aa  253  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.816529  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1221  Altronate dehydratase  37.84 
 
 
507 aa  252  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2373  UxaA family hydrolase  36.91 
 
 
440 aa  252  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.574127  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0825  putative D-galactarate dehydratase/altronate dehydratase  36.91 
 
 
440 aa  252  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1156  UxaA family hydrolase  36.91 
 
 
440 aa  252  7e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1079  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase  36.91 
 
 
440 aa  252  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.750855  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1789  UxaA family hydrolase  36.91 
 
 
440 aa  252  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3576  Altronate dehydratase  37.66 
 
 
510 aa  252  8.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0806  UxaA family hydrolase  36.87 
 
 
514 aa  250  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.941516  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4448  Altronate dehydratase  37.75 
 
 
508 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5478  Altronate dehydratase  38.11 
 
 
508 aa  250  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767398  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4671  Altronate dehydratase  37.34 
 
 
523 aa  250  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2216  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  36.43 
 
 
387 aa  250  4e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.166546  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0756  UxaA family hydrolase  36.87 
 
 
514 aa  249  5e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3904  galactarate dehydratase  36.62 
 
 
514 aa  249  5e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1606  dehydratase; D-galactarate dehydratase; altronate dehydratase  36.57 
 
 
429 aa  249  6e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1615  putative altronate hydrolase (ALTRONIC acid hydratase) protein  37.37 
 
 
519 aa  248  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135092  normal  0.0340906 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1124  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain-containing protein  36.55 
 
 
386 aa  247  3e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1247  Altronate dehydratase  37.34 
 
 
507 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.665181  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2430  Altronate dehydratase  37.12 
 
 
402 aa  246  6.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6103  D-galactarate dehydratase  36.68 
 
 
510 aa  245  9e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0160  Galactarate dehydratase  37.53 
 
 
500 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00621613  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0264  Altronate dehydratase  37.13 
 
 
500 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.530336  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0287  Altronate dehydratase  37.31 
 
 
500 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1702  Altronate dehydratase  38.76 
 
 
508 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1012  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  36.46 
 
 
390 aa  245  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.551016 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0590  Galactarate dehydratase  40.15 
 
 
512 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.413028  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2740  Altronate dehydratase  34.94 
 
 
493 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000642568  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0154  Altronate dehydratase  37.28 
 
 
500 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0475003  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1610  altronate hydrolase  37.06 
 
 
500 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2960  Altronate dehydratase  36.14 
 
 
450 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6916  Altronate dehydratase  36.39 
 
 
439 aa  243  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  normal  0.499575 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2834  UxaA family hydrolase  36.83 
 
 
513 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2948  galactarate dehydratase  36.59 
 
 
513 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439252  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4298  Altronate dehydratase  36.16 
 
 
435 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.968705 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2855  Altronate dehydratase  36.83 
 
 
513 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547251  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1140  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain-containing protein  36.22 
 
 
391 aa  240  2e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.944509 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5155  Altronate dehydratase  37.28 
 
 
515 aa  239  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4262  galactarate dehydratase  37.12 
 
 
507 aa  239  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.892671  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0724  Altronate dehydratase  36.48 
 
 
515 aa  239  5.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1545  Altronate dehydratase  38.73 
 
 
403 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.927457 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>