221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4262 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp1615  putative altronate hydrolase (ALTRONIC acid hydratase) protein  76.39 
 
 		 519 aa  787    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135092  normal  0.0340906 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4278  Altronate dehydratase  77.87 
 
 		 507 aa  820    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569461  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3576  Altronate dehydratase  78.61 
 
 		 510 aa  826    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1952  Galactarate dehydratase  80.83 
 
 		 507 aa  852    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2082  galactarate dehydratase  81.71 
 
 		 509 aa  832    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.315134  normal  0.334548 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4262  galactarate dehydratase  100 
 
 		 507 aa  1036    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.892671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2347  galactarate dehydratase  83.76 
 
 		 509 aa  874    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0724  Altronate dehydratase  63.42 
 
 		 515 aa  676    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0495  Altronate dehydratase  70.3 
 
 		 509 aa  719    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0783  Galactarate dehydratase  55.38 
 
 		 508 aa  591  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3967  Altronate dehydratase  54.79 
 
 		 508 aa  578  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.816529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1537  Altronate dehydratase  56.36 
 
 		 513 aa  578  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.281722 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4448  Altronate dehydratase  54.46 
 
 		 508 aa  565  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5795  Altronate dehydratase  54.65 
 
 		 523 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228862  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5155  Altronate dehydratase  56.47 
 
 		 515 aa  560  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5792  Altronate dehydratase  54.26 
 
 		 523 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4671  Altronate dehydratase  54.33 
 
 		 523 aa  556  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1602  galactarate dehydratase  53.25 
 
 		 513 aa  553  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2834  UxaA family hydrolase  54.85 
 
 		 513 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1027  galactarate dehydratase  52.55 
 
 		 509 aa  551  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2948  galactarate dehydratase  54.46 
 
 		 513 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2855  Altronate dehydratase  54.65 
 
 		 513 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2945  putative D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase  53.53 
 
 		 507 aa  544  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0792126  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0179  galactarate dehydratase  53.54 
 
 		 507 aa  542  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0955  glycogen debranching protein GlgX  51.98 
 
 		 508 aa  540  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00705486  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4928  galactarate dehydratase  51.79 
 
 		 508 aa  540  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1702  Altronate dehydratase  52.48 
 
 		 508 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6308  Altronate dehydratase  54.9 
 
 		 507 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6467  Altronate dehydratase  54.9 
 
 		 507 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457294  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6702  Altronate dehydratase  54.9 
 
 		 507 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3059  galactarate dehydratase  53.33 
 
 		 507 aa  538  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5478  Altronate dehydratase  54.42 
 
 		 508 aa  535  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3970  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like  51.8 
 
 		 509 aa  531  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6583  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  52.16 
 
 		 517 aa  530  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0600477  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3904  galactarate dehydratase  51.29 
 
 		 514 aa  531  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0806  UxaA family hydrolase  52.51 
 
 		 514 aa  526  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.941516  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1221  Altronate dehydratase  54.74 
 
 		 507 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1862  galactarate dehydratase  53.63 
 
 		 538 aa  525  1e-148  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0582  Altronate dehydratase  52.11 
 
 		 533 aa  525  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1247  Altronate dehydratase  54.55 
 
 		 507 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.665181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2068  Altronate dehydratase  55.36 
 
 		 511 aa  525  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0756  UxaA family hydrolase  52.3 
 
 		 514 aa  523  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6103  D-galactarate dehydratase  51.97 
 
 		 510 aa  520  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6599  galactarate dehydratase  51.29 
 
 		 516 aa  508  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1749  Altronate dehydratase  50.59 
 
 		 510 aa  489  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548358  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1610  altronate hydrolase  50 
 
 		 500 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0264  Altronate dehydratase  49.5 
 
 		 500 aa  475  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.530336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07160  altronate dehydratase  48.9 
 
 		 508 aa  472  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0589773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05270  altronate dehydratase  49.3 
 
 		 525 aa  474  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0287  Altronate dehydratase  49.5 
 
 		 500 aa  472  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3225  Altronate dehydratase  51.21 
 
 		 501 aa  467  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2533  Galactarate dehydratase  48.41 
 
 		 533 aa  462  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0590  Galactarate dehydratase  48.71 
 
 		 512 aa  461  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.413028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3898  uronate isomerase  48.22 
 
 		 510 aa  451  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.90307  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3799  Altronate dehydratase  46.63 
 
 		 526 aa  450  1e-125  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0160  Galactarate dehydratase  47.62 
 
 		 500 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00621613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0154  Altronate dehydratase  48.02 
 
 		 500 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0475003  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0806  galactarate dehydratase  36.83 
 
 		 524 aa  300  3e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2484  galactarate dehydratase  36.4 
 
 		 533 aa  296  5e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000132334 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0830  D-galactarate dehydratase  36.8 
 
 		 533 aa  295  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1998  galactarate dehydratase  37.5 
 
 		 520 aa  295  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.257982  normal  0.434412 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6490  (D)-galactarate dehydrogenase  38.04 
 
 		 513 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1064  altronate hydrolase  35.21 
 
 		 505 aa  291  2e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.343724  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3104  galactarate dehydratase  35.56 
 
 		 548 aa  289  7e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0840  galactarate dehydratase  35.98 
 
 		 524 aa  289  9e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3513  galactarate dehydratase  35.27 
 
 		 523 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3550  galactarate dehydratase  35.27 
 
 		 523 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0864027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0256  galactarate dehydratase  36.22 
 
 		 521 aa  288  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.808997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3444  galactarate dehydratase  35.27 
 
 		 523 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3442  galactarate dehydratase  35.27 
 
 		 523 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3398  galactarate dehydratase  35.93 
 
 		 524 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4448  galactarate dehydratase  36.24 
 
 		 533 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0860733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4582  galactarate dehydratase  36.24 
 
 		 533 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.699937  normal  0.473159 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2595  galactarate dehydratase  37.58 
 
 		 518 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.865762  normal  0.097428 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1597  galactarate dehydratase  36.13 
 
 		 532 aa  287  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3265  galactarate dehydratase  37.94 
 
 		 530 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.133789 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0207  Altronate dehydratase  40 
 
 		 390 aa  286  5e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1218  galactarate dehydratase  37.17 
 
 		 518 aa  286  5e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0502126  normal  0.0293032 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0333  galactarate dehydratase  35.9 
 
 		 517 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4865  galactarate dehydratase  34.36 
 
 		 529 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0784645  normal  0.0391217 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1138  galactarate dehydratase  36.62 
 
 		 523 aa  285  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2816  galactarate dehydratase  38.36 
 
 		 517 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0628742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3409  galactarate dehydratase  36.22 
 
 		 518 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.219407  normal  0.594385 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05250  D-galactarate dehydratase  37.65 
 
 		 517 aa  284  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1721  galactarate dehydratase  34.84 
 
 		 529 aa  283  5.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0799571  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2315  galactarate dehydratase  38.36 
 
 		 517 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.761535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3558  galactarate dehydratase  35.07 
 
 		 524 aa  282  9e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5203  galactarate dehydratase  35.9 
 
 		 517 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.175909 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4675  galactarate dehydratase  35.9 
 
 		 517 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.654315 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3690  galactarate dehydratase  35.39 
 
 		 524 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4684  galactarate dehydratase  37.76 
 
 		 516 aa  280  5e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.360454  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3100  galactarate dehydratase  37.93 
 
 		 517 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0190  D-galactarate dehydratase  36.64 
 
 		 564 aa  280  6e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3043  Altronate dehydratase  38.42 
 
 		 500 aa  280  6e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.551416  normal  0.217859 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3601  D-galactarate dehydratase, putative  37.93 
 
 		 517 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.271934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6382  galactarate dehydratase  34.64 
 
 		 530 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.695023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4952  galactarate dehydratase  35.9 
 
 		 517 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.966649  normal  0.0126934 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4734  galactarate dehydratase  34.36 
 
 		 530 aa  278  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.481286  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3050  galactarate dehydratase  35.9 
 
 		 517 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5316  galactarate dehydratase  35.9 
 
 		 517 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.522817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>