197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0207 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0207  Altronate dehydratase  100 
 
 
390 aa  787    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3275  Altronate dehydratase  54.95 
 
 
385 aa  404  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.549273  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0707  UxaA family hydrolase  51.29 
 
 
408 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250621  normal  0.872847 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0810  UxaA family hydrolase  51.29 
 
 
388 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.107485  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0753  UxaA family hydrolase  51.55 
 
 
408 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.371457  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0767  UxaA family hydrolase  51.29 
 
 
388 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0693  hydrolase, UxaA family  51.29 
 
 
388 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0782051  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0126  Altronate dehydratase  50.26 
 
 
389 aa  372  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1451  altronate hydrolase  47.38 
 
 
388 aa  351  1e-95  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4456  Altronate dehydratase  51.69 
 
 
395 aa  341  1e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.0000308674  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1064  altronate hydrolase  43.26 
 
 
505 aa  325  8.000000000000001e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.343724  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0582  Altronate dehydratase  45.01 
 
 
533 aa  305  7e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6467  Altronate dehydratase  42.13 
 
 
507 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457294  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6702  Altronate dehydratase  42.13 
 
 
507 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6308  Altronate dehydratase  41.88 
 
 
507 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6583  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  41.58 
 
 
517 aa  296  4e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0600477  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2051  Altronate dehydratase  42.64 
 
 
384 aa  295  9e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000291794  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2216  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  43.31 
 
 
387 aa  294  1e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.166546  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4418  Altronate dehydratase  42.3 
 
 
384 aa  292  6e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0481  Galactarate dehydratase  40.67 
 
 
385 aa  292  7e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4278  Altronate dehydratase  40.56 
 
 
507 aa  292  9e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569461  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3576  Altronate dehydratase  40 
 
 
510 aa  291  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2945  putative D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase  42.57 
 
 
507 aa  291  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0792126  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1615  putative altronate hydrolase (ALTRONIC acid hydratase) protein  40.65 
 
 
519 aa  290  3e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135092  normal  0.0340906 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6599  galactarate dehydratase  40.49 
 
 
516 aa  290  4e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05270  altronate dehydratase  40.61 
 
 
525 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5478  Altronate dehydratase  42.32 
 
 
508 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767398  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3970  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like  39.6 
 
 
509 aa  289  6e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1221  Altronate dehydratase  43 
 
 
507 aa  288  8e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1124  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain-containing protein  43.27 
 
 
386 aa  288  8e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1247  Altronate dehydratase  42.75 
 
 
507 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.665181  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07160  altronate dehydratase  44.96 
 
 
508 aa  288  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0589773  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1952  Galactarate dehydratase  39.5 
 
 
507 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5795  Altronate dehydratase  41.48 
 
 
523 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228862  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2068  Altronate dehydratase  43.85 
 
 
511 aa  286  4e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186874  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4262  galactarate dehydratase  40 
 
 
507 aa  286  4e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.892671  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2462  Altronate dehydratase  42.19 
 
 
392 aa  286  5e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1140  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain-containing protein  42.59 
 
 
391 aa  286  5e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.944509 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3804  Altronate dehydratase  40.94 
 
 
384 aa  285  8e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1862  galactarate dehydratase  41.06 
 
 
538 aa  285  8e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0724  Altronate dehydratase  40 
 
 
515 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0590  Galactarate dehydratase  43.5 
 
 
512 aa  283  5.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.413028  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0179  galactarate dehydratase  41.21 
 
 
507 aa  283  5.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3967  Altronate dehydratase  41.31 
 
 
508 aa  282  9e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.816529  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4671  Altronate dehydratase  39 
 
 
523 aa  281  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5155  Altronate dehydratase  39.85 
 
 
515 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2324  Altronate dehydratase  42.16 
 
 
387 aa  281  2e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5792  Altronate dehydratase  40.5 
 
 
523 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1602  galactarate dehydratase  39.65 
 
 
513 aa  280  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3059  galactarate dehydratase  41.29 
 
 
507 aa  279  6e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364841  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1537  Altronate dehydratase  40.5 
 
 
513 aa  279  6e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.281722 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0955  glycogen debranching protein GlgX  39.5 
 
 
508 aa  278  9e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00705486  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6357  Altronate dehydratase  41.04 
 
 
384 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.194037  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0783  Galactarate dehydratase  39.8 
 
 
508 aa  277  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5298  Altronate dehydratase  41.56 
 
 
384 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2855  Altronate dehydratase  39.11 
 
 
513 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547251  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2834  UxaA family hydrolase  39.11 
 
 
513 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2948  galactarate dehydratase  39.11 
 
 
513 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439252  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1754  Altronate dehydratase  40.3 
 
 
514 aa  276  5e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2347  galactarate dehydratase  38.75 
 
 
509 aa  276  5e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1012  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  41.15 
 
 
390 aa  275  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.551016 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3225  Altronate dehydratase  41.07 
 
 
501 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3799  Altronate dehydratase  40.84 
 
 
526 aa  275  1.0000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1027  galactarate dehydratase  39.8 
 
 
509 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2533  Galactarate dehydratase  41.55 
 
 
533 aa  272  9e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2082  galactarate dehydratase  39.25 
 
 
509 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.315134  normal  0.334548 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4928  galactarate dehydratase  38.46 
 
 
508 aa  271  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0806  UxaA family hydrolase  38.54 
 
 
514 aa  270  5e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.941516  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3898  uronate isomerase  40.21 
 
 
510 aa  268  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.90307  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4448  Altronate dehydratase  39.38 
 
 
508 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2590  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like protein  39.84 
 
 
384 aa  268  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0469328  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0495  Altronate dehydratase  39.49 
 
 
509 aa  268  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3904  galactarate dehydratase  38.54 
 
 
514 aa  268  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1702  Altronate dehydratase  41.13 
 
 
508 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0756  UxaA family hydrolase  38.78 
 
 
514 aa  266  5e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6103  D-galactarate dehydratase  39.14 
 
 
510 aa  265  8.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2003  Altronate dehydratase  40.16 
 
 
387 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0800  Altronate dehydratase  38.72 
 
 
512 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2005  Altronate dehydratase  40.16 
 
 
387 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0228  D-altronate dehydratase  41.9 
 
 
503 aa  263  4e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0264  Altronate dehydratase  39.4 
 
 
500 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.530336  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1610  altronate hydrolase  39.25 
 
 
500 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6087  Altronate dehydratase  40.93 
 
 
391 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1766  Altronate dehydratase  41.24 
 
 
389 aa  261  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0211518  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3819  Altronate dehydratase  39.39 
 
 
391 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.257566  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0287  Altronate dehydratase  39 
 
 
500 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1749  Altronate dehydratase  38.73 
 
 
510 aa  260  3e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548358  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0160  Galactarate dehydratase  39.54 
 
 
500 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00621613  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0154  Altronate dehydratase  39.54 
 
 
500 aa  258  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0475003  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3043  Altronate dehydratase  40.91 
 
 
500 aa  256  4e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.551416  normal  0.217859 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1575  Altronate dehydratase  38.87 
 
 
498 aa  256  4e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0892  Altronate dehydratase  39.55 
 
 
408 aa  256  5e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2740  Altronate dehydratase  38.36 
 
 
493 aa  256  7e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000642568  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3529  Altronate dehydratase  40.16 
 
 
391 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2375  Altronate dehydratase  39.12 
 
 
386 aa  253  6e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.602236  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2038  putative altronate hydrolase  39.13 
 
 
393 aa  250  4e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.624711  normal  0.146869 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5979  Altronate dehydratase  40.21 
 
 
426 aa  248  9e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.25481 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3512  D-altronate dehydratase  39.21 
 
 
507 aa  246  6.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3706  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  40.36 
 
 
426 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2430  Altronate dehydratase  38.68 
 
 
402 aa  245  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>