197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2051 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2051  Altronate dehydratase  100 
 
 
384 aa  787    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000291794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4418  Altronate dehydratase  82.55 
 
 
384 aa  673    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2590  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like protein  65.97 
 
 
384 aa  531  1e-150  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0469328  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3819  Altronate dehydratase  60.26 
 
 
391 aa  479  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.257566  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0892  Altronate dehydratase  59.74 
 
 
408 aa  481  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2375  Altronate dehydratase  58.81 
 
 
386 aa  473  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.602236  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6087  Altronate dehydratase  59.64 
 
 
391 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2005  Altronate dehydratase  59.69 
 
 
387 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2003  Altronate dehydratase  59.69 
 
 
387 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2324  Altronate dehydratase  59.79 
 
 
387 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5979  Altronate dehydratase  58.07 
 
 
426 aa  462  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.25481 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3529  Altronate dehydratase  59.11 
 
 
391 aa  464  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3706  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  59.11 
 
 
426 aa  464  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2156  Altronate dehydratase  56.99 
 
 
386 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2216  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  57.47 
 
 
387 aa  456  1e-127  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.166546  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0481  Galactarate dehydratase  58.47 
 
 
385 aa  456  1e-127  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2038  putative altronate hydrolase  57.55 
 
 
393 aa  457  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.624711  normal  0.146869 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1766  Altronate dehydratase  59.9 
 
 
389 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0211518  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1124  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain-containing protein  57.81 
 
 
386 aa  454  1.0000000000000001e-126  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2462  Altronate dehydratase  56.62 
 
 
392 aa  442  1e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1140  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain-containing protein  57.7 
 
 
391 aa  442  1e-123  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.944509 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1012  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  55.87 
 
 
390 aa  438  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.551016 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0207  Altronate dehydratase  42.64 
 
 
390 aa  295  9e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0753  UxaA family hydrolase  39.79 
 
 
408 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.371457  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0707  UxaA family hydrolase  39.79 
 
 
408 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250621  normal  0.872847 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0810  UxaA family hydrolase  39.79 
 
 
388 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.107485  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0767  UxaA family hydrolase  39.79 
 
 
388 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0693  hydrolase, UxaA family  39.79 
 
 
388 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0782051  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3275  Altronate dehydratase  40.73 
 
 
385 aa  278  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.549273  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5298  Altronate dehydratase  38.16 
 
 
384 aa  270  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6357  Altronate dehydratase  38.16 
 
 
384 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.194037  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3804  Altronate dehydratase  36.55 
 
 
384 aa  263  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0126  Altronate dehydratase  35.26 
 
 
389 aa  238  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4456  Altronate dehydratase  40.98 
 
 
395 aa  229  6e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.0000308674  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1451  altronate hydrolase  35.34 
 
 
388 aa  225  1e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1064  altronate hydrolase  32.74 
 
 
505 aa  218  1e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.343724  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1602  galactarate dehydratase  32.57 
 
 
513 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2945  putative D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase  32.73 
 
 
507 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0792126  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0955  glycogen debranching protein GlgX  31.01 
 
 
508 aa  173  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00705486  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3898  uronate isomerase  30.58 
 
 
510 aa  173  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.90307  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3855  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain-containing protein  33.68 
 
 
393 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00201653  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0582  Altronate dehydratase  31.68 
 
 
533 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6467  Altronate dehydratase  30.85 
 
 
507 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457294  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6702  Altronate dehydratase  30.85 
 
 
507 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4671  Altronate dehydratase  31.28 
 
 
523 aa  171  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6308  Altronate dehydratase  30.85 
 
 
507 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1749  Altronate dehydratase  30.38 
 
 
510 aa  169  6e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548358  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6103  D-galactarate dehydratase  30.87 
 
 
510 aa  169  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3970  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like  31.11 
 
 
509 aa  169  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07160  altronate dehydratase  32.02 
 
 
508 aa  169  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0589773  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1218  galactarate dehydratase  32.09 
 
 
518 aa  169  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0502126  normal  0.0293032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2948  galactarate dehydratase  32.75 
 
 
513 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439252  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2834  UxaA family hydrolase  32.24 
 
 
513 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3904  galactarate dehydratase  30.1 
 
 
514 aa  166  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2855  Altronate dehydratase  32.24 
 
 
513 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547251  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5155  Altronate dehydratase  30.98 
 
 
515 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3059  galactarate dehydratase  30.31 
 
 
507 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364841  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05270  altronate dehydratase  30.03 
 
 
525 aa  164  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0287  Altronate dehydratase  31.14 
 
 
500 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1610  altronate hydrolase  30.89 
 
 
500 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5478  Altronate dehydratase  30.26 
 
 
508 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767398  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0806  UxaA family hydrolase  29.85 
 
 
514 aa  162  6e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.941516  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3225  Altronate dehydratase  30.67 
 
 
501 aa  163  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2068  Altronate dehydratase  31.57 
 
 
511 aa  162  7e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186874  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0264  Altronate dehydratase  30.89 
 
 
500 aa  162  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.530336  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05250  D-galactarate dehydratase  31.34 
 
 
517 aa  161  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6583  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  30.79 
 
 
517 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0600477  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0756  UxaA family hydrolase  29.62 
 
 
514 aa  162  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1027  galactarate dehydratase  31 
 
 
509 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0228  D-altronate dehydratase  29.79 
 
 
503 aa  160  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1754  Altronate dehydratase  31.44 
 
 
514 aa  160  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0179  galactarate dehydratase  30.26 
 
 
507 aa  160  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6599  galactarate dehydratase  31.3 
 
 
516 aa  160  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2740  Altronate dehydratase  29.6 
 
 
493 aa  160  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000642568  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3799  Altronate dehydratase  29.85 
 
 
526 aa  159  6e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1702  Altronate dehydratase  31.61 
 
 
508 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3043  Altronate dehydratase  30.2 
 
 
500 aa  159  9e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.551416  normal  0.217859 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2430  Altronate dehydratase  32.83 
 
 
402 aa  158  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1952  Galactarate dehydratase  31.2 
 
 
507 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1537  Altronate dehydratase  28.68 
 
 
513 aa  157  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.281722 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2533  Galactarate dehydratase  28.26 
 
 
533 aa  156  6e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3967  Altronate dehydratase  29.21 
 
 
508 aa  156  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.816529  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1862  galactarate dehydratase  30.53 
 
 
538 aa  156  7e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2960  Altronate dehydratase  31.46 
 
 
450 aa  155  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1545  Altronate dehydratase  30.4 
 
 
403 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3512  D-altronate dehydratase  34.79 
 
 
507 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0154  Altronate dehydratase  30.33 
 
 
500 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0475003  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0160  Galactarate dehydratase  30.03 
 
 
500 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00621613  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0783  Galactarate dehydratase  29.21 
 
 
508 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2373  UxaA family hydrolase  30.6 
 
 
440 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.574127  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0825  putative D-galactarate dehydratase/altronate dehydratase  30.6 
 
 
440 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1156  UxaA family hydrolase  30.6 
 
 
440 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1079  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase  30.6 
 
 
440 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.750855  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1789  UxaA family hydrolase  30.6 
 
 
440 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1221  Altronate dehydratase  29.82 
 
 
507 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4448  Altronate dehydratase  28.39 
 
 
508 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5792  Altronate dehydratase  31.16 
 
 
523 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4258  Altronate dehydratase  33.44 
 
 
540 aa  152  8e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.350711  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6916  Altronate dehydratase  31.6 
 
 
439 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  normal  0.499575 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1575  Altronate dehydratase  29.53 
 
 
498 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>