197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5979 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5979  Altronate dehydratase  100 
 
 		 426 aa  883    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.25481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3706  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  90.38 
 
 		 426 aa  801    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2038  putative altronate hydrolase  75.77 
 
 		 393 aa  630  1e-179  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.624711  normal  0.146869 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2003  Altronate dehydratase  71.39 
 
 		 387 aa  570  1e-161  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2005  Altronate dehydratase  71.39 
 
 		 387 aa  570  1e-161  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2375  Altronate dehydratase  69.87 
 
 		 386 aa  558  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.602236  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3819  Altronate dehydratase  70.13 
 
 		 391 aa  551  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.257566  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0892  Altronate dehydratase  69.35 
 
 		 408 aa  551  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2156  Altronate dehydratase  67.97 
 
 		 386 aa  545  1e-154  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2590  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like protein  67.45 
 
 		 384 aa  538  9.999999999999999e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0469328  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6087  Altronate dehydratase  69.35 
 
 		 391 aa  528  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3529  Altronate dehydratase  69.09 
 
 		 391 aa  528  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2324  Altronate dehydratase  67.1 
 
 		 387 aa  530  1e-149  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1766  Altronate dehydratase  67.53 
 
 		 389 aa  514  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0211518  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4418  Altronate dehydratase  59.64 
 
 		 384 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2051  Altronate dehydratase  58.07 
 
 		 384 aa  462  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000291794  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0481  Galactarate dehydratase  54.55 
 
 		 385 aa  433  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1124  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain-containing protein  55.67 
 
 		 386 aa  422  1e-117  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1012  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  55.78 
 
 		 390 aa  413  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.551016 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2216  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  54.4 
 
 		 387 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.166546  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2462  Altronate dehydratase  54.81 
 
 		 392 aa  400  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1140  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain-containing protein  53.87 
 
 		 391 aa  395  1e-109  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.944509 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3804  Altronate dehydratase  39.06 
 
 		 384 aa  266  5e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0707  UxaA family hydrolase  39.32 
 
 		 408 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250621  normal  0.872847 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3275  Altronate dehydratase  40.43 
 
 		 385 aa  264  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.549273  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0810  UxaA family hydrolase  39.32 
 
 		 388 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.107485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0767  UxaA family hydrolase  39.32 
 
 		 388 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0693  hydrolase, UxaA family  39.32 
 
 		 388 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0782051  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0753  UxaA family hydrolase  39.32 
 
 		 408 aa  263  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.371457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5298  Altronate dehydratase  38.08 
 
 		 384 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6357  Altronate dehydratase  37.31 
 
 		 384 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.194037  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0207  Altronate dehydratase  40.21 
 
 		 390 aa  248  1e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0126  Altronate dehydratase  35.42 
 
 		 389 aa  227  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4456  Altronate dehydratase  36.88 
 
 		 395 aa  199  5e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.0000308674  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1451  altronate hydrolase  33.51 
 
 		 388 aa  194  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1064  altronate hydrolase  29.57 
 
 		 505 aa  192  1e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.343724  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2533  Galactarate dehydratase  32.11 
 
 		 533 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2834  UxaA family hydrolase  32.59 
 
 		 513 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2068  Altronate dehydratase  33.33 
 
 		 511 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1749  Altronate dehydratase  33 
 
 		 510 aa  173  5e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548358  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2855  Altronate dehydratase  32.59 
 
 		 513 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2948  galactarate dehydratase  31.73 
 
 		 513 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3059  galactarate dehydratase  32.51 
 
 		 507 aa  169  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0582  Altronate dehydratase  33.59 
 
 		 533 aa  168  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1602  galactarate dehydratase  32.46 
 
 		 513 aa  168  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6308  Altronate dehydratase  30.93 
 
 		 507 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1545  Altronate dehydratase  30.6 
 
 		 403 aa  166  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4448  Altronate dehydratase  31.51 
 
 		 508 aa  167  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2945  putative D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase  32.5 
 
 		 507 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0792126  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1754  Altronate dehydratase  32.82 
 
 		 514 aa  164  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5792  Altronate dehydratase  32.43 
 
 		 523 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3225  Altronate dehydratase  31.27 
 
 		 501 aa  164  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1862  galactarate dehydratase  33.58 
 
 		 538 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3855  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain-containing protein  31.59 
 
 		 393 aa  163  6e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00201653  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5155  Altronate dehydratase  30.86 
 
 		 515 aa  162  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3967  Altronate dehydratase  30.27 
 
 		 508 aa  162  9e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.816529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6467  Altronate dehydratase  30.62 
 
 		 507 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457294  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6702  Altronate dehydratase  30.62 
 
 		 507 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6583  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  31.45 
 
 		 517 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0600477  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1537  Altronate dehydratase  30.42 
 
 		 513 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.281722 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6103  D-galactarate dehydratase  33.08 
 
 		 510 aa  161  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5478  Altronate dehydratase  30.98 
 
 		 508 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5795  Altronate dehydratase  31.44 
 
 		 523 aa  160  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228862  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05270  altronate dehydratase  31 
 
 		 525 aa  160  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2430  Altronate dehydratase  30.79 
 
 		 402 aa  159  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3799  Altronate dehydratase  32.42 
 
 		 526 aa  159  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0955  glycogen debranching protein GlgX  30.03 
 
 		 508 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00705486  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4928  galactarate dehydratase  30.48 
 
 		 508 aa  158  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3898  uronate isomerase  31.02 
 
 		 510 aa  158  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.90307  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0154  Altronate dehydratase  31.16 
 
 		 500 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0475003  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0160  Galactarate dehydratase  30.9 
 
 		 500 aa  156  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00621613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1027  galactarate dehydratase  29.98 
 
 		 509 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0783  Galactarate dehydratase  29.53 
 
 		 508 aa  154  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1221  Altronate dehydratase  30.67 
 
 		 507 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6599  galactarate dehydratase  30.54 
 
 		 516 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1247  Altronate dehydratase  30.42 
 
 		 507 aa  153  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.665181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0590  Galactarate dehydratase  32.26 
 
 		 512 aa  152  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.413028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0179  galactarate dehydratase  32.06 
 
 		 507 aa  152  8e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0264  Altronate dehydratase  30.45 
 
 		 500 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.530336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1575  Altronate dehydratase  30.36 
 
 		 498 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4298  Altronate dehydratase  29.18 
 
 		 435 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.968705 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0806  UxaA family hydrolase  31.5 
 
 		 514 aa  150  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.941516  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1610  altronate hydrolase  30.2 
 
 		 500 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0287  Altronate dehydratase  30.2 
 
 		 500 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07160  altronate dehydratase  31.38 
 
 		 508 aa  150  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0589773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1702  Altronate dehydratase  30.62 
 
 		 508 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3970  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like  29.35 
 
 		 509 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4671  Altronate dehydratase  30.14 
 
 		 523 aa  149  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3043  Altronate dehydratase  29.93 
 
 		 500 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.551416  normal  0.217859 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0756  UxaA family hydrolase  31.25 
 
 		 514 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3904  galactarate dehydratase  31 
 
 		 514 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0800  Altronate dehydratase  29.92 
 
 		 512 aa  147  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0228  D-altronate dehydratase  32.15 
 
 		 503 aa  147  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2740  Altronate dehydratase  29.4 
 
 		 493 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000642568  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3576  Altronate dehydratase  29.31 
 
 		 510 aa  144  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3512  D-altronate dehydratase  31.67 
 
 		 507 aa  144  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1606  dehydratase; D-galactarate dehydratase; altronate dehydratase  29.13 
 
 		 429 aa  144  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0840  galactarate dehydratase  30.39 
 
 		 524 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2960  Altronate dehydratase  28.85 
 
 		 450 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0724  Altronate dehydratase  28.21 
 
 		 515 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>