197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2462 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2462  Altronate dehydratase  100 
 
 		 392 aa  801    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1012  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  85.01 
 
 		 390 aa  686    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.551016 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1140  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain-containing protein  63.31 
 
 		 391 aa  496  1e-139  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.944509 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2216  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  62.83 
 
 		 387 aa  493  9.999999999999999e-139  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.166546  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2590  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like protein  64.66 
 
 		 384 aa  491  9.999999999999999e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0469328  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1124  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain-containing protein  62.34 
 
 		 386 aa  486  1e-136  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4418  Altronate dehydratase  59.48 
 
 		 384 aa  462  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0481  Galactarate dehydratase  57.4 
 
 		 385 aa  463  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3819  Altronate dehydratase  59.79 
 
 		 391 aa  450  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.257566  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2051  Altronate dehydratase  56.62 
 
 		 384 aa  442  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000291794  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0892  Altronate dehydratase  58.76 
 
 		 408 aa  441  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2375  Altronate dehydratase  59.01 
 
 		 386 aa  444  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.602236  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2005  Altronate dehydratase  58.01 
 
 		 387 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2156  Altronate dehydratase  57.11 
 
 		 386 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2003  Altronate dehydratase  58.01 
 
 		 387 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1766  Altronate dehydratase  60.63 
 
 		 389 aa  436  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0211518  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2324  Altronate dehydratase  56.77 
 
 		 387 aa  430  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6087  Altronate dehydratase  58.33 
 
 		 391 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3529  Altronate dehydratase  57.81 
 
 		 391 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2038  putative altronate hydrolase  54.85 
 
 		 393 aa  412  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.624711  normal  0.146869 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3706  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  54.89 
 
 		 426 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5979  Altronate dehydratase  54.81 
 
 		 426 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.25481 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0207  Altronate dehydratase  42.19 
 
 		 390 aa  286  5e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3804  Altronate dehydratase  38.26 
 
 		 384 aa  266  5.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3275  Altronate dehydratase  40.26 
 
 		 385 aa  262  8.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.549273  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0126  Altronate dehydratase  36.53 
 
 		 389 aa  262  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0767  UxaA family hydrolase  38.48 
 
 		 388 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0810  UxaA family hydrolase  38.48 
 
 		 388 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.107485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0693  hydrolase, UxaA family  38.48 
 
 		 388 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0782051  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0707  UxaA family hydrolase  38.48 
 
 		 408 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250621  normal  0.872847 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0753  UxaA family hydrolase  38.48 
 
 		 408 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.371457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6357  Altronate dehydratase  39.1 
 
 		 384 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.194037  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5298  Altronate dehydratase  38.56 
 
 		 384 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4456  Altronate dehydratase  38.96 
 
 		 395 aa  243  5e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.0000308674  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1064  altronate hydrolase  36.23 
 
 		 505 aa  239  4e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.343724  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1451  altronate hydrolase  35.25 
 
 		 388 aa  229  7e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07160  altronate dehydratase  33.25 
 
 		 508 aa  180  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0589773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0800  Altronate dehydratase  32.41 
 
 		 512 aa  177  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2533  Galactarate dehydratase  32.69 
 
 		 533 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6103  D-galactarate dehydratase  34.34 
 
 		 510 aa  173  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1862  galactarate dehydratase  32.77 
 
 		 538 aa  173  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0806  UxaA family hydrolase  31.14 
 
 		 514 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.941516  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6308  Altronate dehydratase  29.62 
 
 		 507 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6467  Altronate dehydratase  30.08 
 
 		 507 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457294  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6702  Altronate dehydratase  30.08 
 
 		 507 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6583  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  33.08 
 
 		 517 aa  170  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0600477  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0756  UxaA family hydrolase  30.58 
 
 		 514 aa  169  6e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1537  Altronate dehydratase  30.86 
 
 		 513 aa  169  7e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.281722 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4671  Altronate dehydratase  31.39 
 
 		 523 aa  169  9e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3904  galactarate dehydratase  30.98 
 
 		 514 aa  169  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1602  galactarate dehydratase  31.41 
 
 		 513 aa  168  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3059  galactarate dehydratase  31.62 
 
 		 507 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2740  Altronate dehydratase  30.26 
 
 		 493 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000642568  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5795  Altronate dehydratase  31.63 
 
 		 523 aa  166  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228862  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6599  galactarate dehydratase  32.52 
 
 		 516 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3225  Altronate dehydratase  31.28 
 
 		 501 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0228  D-altronate dehydratase  31.88 
 
 		 503 aa  166  8e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3576  Altronate dehydratase  32.09 
 
 		 510 aa  166  9e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1749  Altronate dehydratase  31.81 
 
 		 510 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548358  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4262  galactarate dehydratase  32.15 
 
 		 507 aa  165  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.892671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5792  Altronate dehydratase  31.58 
 
 		 523 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1027  galactarate dehydratase  31.03 
 
 		 509 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4448  Altronate dehydratase  31.78 
 
 		 508 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0179  galactarate dehydratase  31.98 
 
 		 507 aa  164  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3967  Altronate dehydratase  29.06 
 
 		 508 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.816529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1754  Altronate dehydratase  31.84 
 
 		 514 aa  163  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2948  galactarate dehydratase  32.17 
 
 		 513 aa  163  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439252  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2834  UxaA family hydrolase  31.67 
 
 		 513 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1615  putative altronate hydrolase (ALTRONIC acid hydratase) protein  30 
 
 		 519 aa  161  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135092  normal  0.0340906 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0783  Galactarate dehydratase  30.05 
 
 		 508 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2430  Altronate dehydratase  32.83 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0955  glycogen debranching protein GlgX  30.77 
 
 		 508 aa  161  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00705486  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2068  Altronate dehydratase  31 
 
 		 511 aa  161  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2855  Altronate dehydratase  31.67 
 
 		 513 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3855  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain-containing protein  31.72 
 
 		 393 aa  161  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00201653  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4928  galactarate dehydratase  28.78 
 
 		 508 aa  160  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3970  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like  30.56 
 
 		 509 aa  160  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1545  Altronate dehydratase  30.4 
 
 		 403 aa  159  9e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5155  Altronate dehydratase  29.93 
 
 		 515 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0724  Altronate dehydratase  29.52 
 
 		 515 aa  158  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0582  Altronate dehydratase  30.59 
 
 		 533 aa  159  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0154  Altronate dehydratase  30.73 
 
 		 500 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0475003  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0590  Galactarate dehydratase  32.19 
 
 		 512 aa  158  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.413028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0495  Altronate dehydratase  30.25 
 
 		 509 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3898  uronate isomerase  29.76 
 
 		 510 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.90307  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3799  Altronate dehydratase  30.42 
 
 		 526 aa  157  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4278  Altronate dehydratase  30.98 
 
 		 507 aa  156  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569461  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1610  altronate hydrolase  30.66 
 
 		 500 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1702  Altronate dehydratase  31.22 
 
 		 508 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0160  Galactarate dehydratase  30.12 
 
 		 500 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00621613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05270  altronate dehydratase  30.23 
 
 		 525 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0287  Altronate dehydratase  30.66 
 
 		 500 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2945  putative D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase  30.39 
 
 		 507 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0792126  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0264  Altronate dehydratase  30.66 
 
 		 500 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.530336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0748  Altronate dehydratase  29.6 
 
 		 496 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1221  Altronate dehydratase  28.57 
 
 		 507 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1102  altronate hydrolase  28.86 
 
 		 496 aa  151  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0493  altronate dehydratase  28.86 
 
 		 496 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5478  Altronate dehydratase  28.75 
 
 		 508 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0691  Altronate dehydratase  27.88 
 
 		 496 aa  150  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>