197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1012 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1012  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  100 
 
 		 390 aa  793    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.551016 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2462  Altronate dehydratase  85.01 
 
 		 392 aa  686    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1140  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain-containing protein  64.57 
 
 		 391 aa  498  1e-140  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.944509 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2590  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like protein  65.18 
 
 		 384 aa  495  1e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0469328  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1124  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain-containing protein  63.9 
 
 		 386 aa  493  9.999999999999999e-139  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2216  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  62.57 
 
 		 387 aa  489  1e-137  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.166546  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0481  Galactarate dehydratase  58.75 
 
 		 385 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4418  Altronate dehydratase  58.22 
 
 		 384 aa  457  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2005  Altronate dehydratase  58.81 
 
 		 387 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2003  Altronate dehydratase  58.81 
 
 		 387 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2324  Altronate dehydratase  57.92 
 
 		 387 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2156  Altronate dehydratase  57.14 
 
 		 386 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2375  Altronate dehydratase  57.7 
 
 		 386 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.602236  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3819  Altronate dehydratase  59.32 
 
 		 391 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.257566  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1766  Altronate dehydratase  61.68 
 
 		 389 aa  444  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0211518  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0892  Altronate dehydratase  58.79 
 
 		 408 aa  438  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2051  Altronate dehydratase  55.87 
 
 		 384 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000291794  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6087  Altronate dehydratase  57.76 
 
 		 391 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2038  putative altronate hydrolase  55.44 
 
 		 393 aa  427  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.624711  normal  0.146869 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3706  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  57.77 
 
 		 426 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3529  Altronate dehydratase  57.51 
 
 		 391 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5979  Altronate dehydratase  55.78 
 
 		 426 aa  413  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.25481 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0207  Altronate dehydratase  41.15 
 
 		 390 aa  275  1.0000000000000001e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3804  Altronate dehydratase  38.26 
 
 		 384 aa  262  6e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0126  Altronate dehydratase  36.69 
 
 		 389 aa  256  6e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6357  Altronate dehydratase  38.68 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.194037  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0707  UxaA family hydrolase  36.46 
 
 		 408 aa  245  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250621  normal  0.872847 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0810  UxaA family hydrolase  36.46 
 
 		 388 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.107485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0767  UxaA family hydrolase  36.46 
 
 		 388 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0693  hydrolase, UxaA family  36.46 
 
 		 388 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0782051  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3275  Altronate dehydratase  37.92 
 
 		 385 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.549273  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0753  UxaA family hydrolase  36.46 
 
 		 408 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.371457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5298  Altronate dehydratase  38.06 
 
 		 384 aa  244  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4456  Altronate dehydratase  40 
 
 		 395 aa  241  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.0000308674  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1064  altronate hydrolase  35.25 
 
 		 505 aa  239  4e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.343724  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1451  altronate hydrolase  34.46 
 
 		 388 aa  232  1e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1754  Altronate dehydratase  33.16 
 
 		 514 aa  176  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0228  D-altronate dehydratase  32.65 
 
 		 503 aa  175  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2533  Galactarate dehydratase  32.84 
 
 		 533 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0800  Altronate dehydratase  31.88 
 
 		 512 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6583  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  33.75 
 
 		 517 aa  170  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0600477  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3225  Altronate dehydratase  31.16 
 
 		 501 aa  169  8e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4448  Altronate dehydratase  31.84 
 
 		 508 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6599  galactarate dehydratase  33.67 
 
 		 516 aa  166  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3059  galactarate dehydratase  31.27 
 
 		 507 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05270  altronate dehydratase  31.49 
 
 		 525 aa  166  8e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6467  Altronate dehydratase  31.41 
 
 		 507 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457294  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6702  Altronate dehydratase  31.41 
 
 		 507 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1862  galactarate dehydratase  32.35 
 
 		 538 aa  166  9e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1027  galactarate dehydratase  31.2 
 
 		 509 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6308  Altronate dehydratase  31.16 
 
 		 507 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2740  Altronate dehydratase  30.05 
 
 		 493 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000642568  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1545  Altronate dehydratase  32.42 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0806  UxaA family hydrolase  30.63 
 
 		 514 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.941516  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1735  Altronate dehydratase  30.19 
 
 		 546 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.969827  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2834  UxaA family hydrolase  32.49 
 
 		 513 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07160  altronate dehydratase  32.14 
 
 		 508 aa  163  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0589773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2855  Altronate dehydratase  32.49 
 
 		 513 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2948  galactarate dehydratase  32.74 
 
 		 513 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5792  Altronate dehydratase  31.3 
 
 		 523 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5155  Altronate dehydratase  30.58 
 
 		 515 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0756  UxaA family hydrolase  30.38 
 
 		 514 aa  160  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3855  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain-containing protein  32.64 
 
 		 393 aa  161  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00201653  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2430  Altronate dehydratase  32.84 
 
 		 402 aa  160  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5795  Altronate dehydratase  31.03 
 
 		 523 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228862  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3512  D-altronate dehydratase  34.02 
 
 		 507 aa  160  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0955  glycogen debranching protein GlgX  30.41 
 
 		 508 aa  159  8e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00705486  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1702  Altronate dehydratase  32.07 
 
 		 508 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4262  galactarate dehydratase  31.34 
 
 		 507 aa  159  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.892671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1537  Altronate dehydratase  30.48 
 
 		 513 aa  158  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.281722 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0724  Altronate dehydratase  30.08 
 
 		 515 aa  157  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2068  Altronate dehydratase  30.85 
 
 		 511 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0590  Galactarate dehydratase  32.23 
 
 		 512 aa  157  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.413028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0264  Altronate dehydratase  30.02 
 
 		 500 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.530336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1610  altronate hydrolase  29.98 
 
 		 500 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4928  galactarate dehydratase  29.29 
 
 		 508 aa  156  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0287  Altronate dehydratase  31.2 
 
 		 500 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1602  galactarate dehydratase  30.71 
 
 		 513 aa  156  5.0000000000000005e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0582  Altronate dehydratase  31.77 
 
 		 533 aa  155  8e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3799  Altronate dehydratase  30.71 
 
 		 526 aa  155  9e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3967  Altronate dehydratase  29.05 
 
 		 508 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.816529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4671  Altronate dehydratase  29.31 
 
 		 523 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3904  galactarate dehydratase  29.62 
 
 		 514 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1575  Altronate dehydratase  30.75 
 
 		 498 aa  153  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1749  Altronate dehydratase  29.9 
 
 		 510 aa  152  7e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548358  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0179  galactarate dehydratase  30.89 
 
 		 507 aa  152  8e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0783  Galactarate dehydratase  29.05 
 
 		 508 aa  152  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2945  putative D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase  30.51 
 
 		 507 aa  152  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0792126  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1615  putative altronate hydrolase (ALTRONIC acid hydratase) protein  29.55 
 
 		 519 aa  152  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135092  normal  0.0340906 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1221  Altronate dehydratase  29.18 
 
 		 507 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6103  D-galactarate dehydratase  30.71 
 
 		 510 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5478  Altronate dehydratase  28.54 
 
 		 508 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0160  Galactarate dehydratase  29.37 
 
 		 500 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00621613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3898  uronate isomerase  28.68 
 
 		 510 aa  150  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.90307  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0154  Altronate dehydratase  29.37 
 
 		 500 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0475003  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2347  galactarate dehydratase  30.91 
 
 		 509 aa  149  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3576  Altronate dehydratase  30.5 
 
 		 510 aa  149  9e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3043  Altronate dehydratase  29.15 
 
 		 500 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.551416  normal  0.217859 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6916  Altronate dehydratase  32.62 
 
 		 439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  normal  0.499575 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1606  dehydratase; D-galactarate dehydratase; altronate dehydratase  30.62 
 
 		 429 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>