197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6916 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4298  Altronate dehydratase  87.39 
 
 		 435 aa  782    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.968705 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2373  UxaA family hydrolase  80.8 
 
 		 440 aa  696    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.574127  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1606  dehydratase; D-galactarate dehydratase; altronate dehydratase  80.24 
 
 		 429 aa  696    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2960  Altronate dehydratase  96.36 
 
 		 450 aa  863    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0825  putative D-galactarate dehydratase/altronate dehydratase  80.8 
 
 		 440 aa  696    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1156  UxaA family hydrolase  80.8 
 
 		 440 aa  696    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1079  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase  80.8 
 
 		 440 aa  696    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.750855  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1789  UxaA family hydrolase  80.8 
 
 		 440 aa  696    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6916  Altronate dehydratase  100 
 
 		 439 aa  893    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  normal  0.499575 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1545  Altronate dehydratase  69.36 
 
 		 403 aa  569  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2430  Altronate dehydratase  68.45 
 
 		 402 aa  551  1e-156  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0753  UxaA family hydrolase  36.63 
 
 		 408 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.371457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0810  UxaA family hydrolase  36.39 
 
 		 388 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.107485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0767  UxaA family hydrolase  36.39 
 
 		 388 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0693  hydrolase, UxaA family  36.39 
 
 		 388 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0782051  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0707  UxaA family hydrolase  36.39 
 
 		 408 aa  242  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250621  normal  0.872847 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0207  Altronate dehydratase  36.54 
 
 		 390 aa  236  6e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3275  Altronate dehydratase  38 
 
 		 385 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.549273  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05270  altronate dehydratase  37.75 
 
 		 525 aa  223  6e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4456  Altronate dehydratase  38.25 
 
 		 395 aa  220  3.9999999999999997e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.0000308674  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0126  Altronate dehydratase  33.58 
 
 		 389 aa  219  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3970  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like  35.75 
 
 		 509 aa  219  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4262  galactarate dehydratase  36.32 
 
 		 507 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.892671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0582  Altronate dehydratase  37.68 
 
 		 533 aa  218  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1615  putative altronate hydrolase (ALTRONIC acid hydratase) protein  35.02 
 
 		 519 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135092  normal  0.0340906 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0955  glycogen debranching protein GlgX  34.83 
 
 		 508 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00705486  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1537  Altronate dehydratase  35.82 
 
 		 513 aa  212  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.281722 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4671  Altronate dehydratase  34.88 
 
 		 523 aa  210  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2855  Altronate dehydratase  35.89 
 
 		 513 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547251  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2834  UxaA family hydrolase  35.89 
 
 		 513 aa  210  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4928  galactarate dehydratase  35.35 
 
 		 508 aa  209  6e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4448  Altronate dehydratase  35.89 
 
 		 508 aa  209  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6583  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  36.76 
 
 		 517 aa  209  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0600477  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6599  galactarate dehydratase  36.83 
 
 		 516 aa  209  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2948  galactarate dehydratase  35.78 
 
 		 513 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2347  galactarate dehydratase  35.89 
 
 		 509 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07160  altronate dehydratase  36.56 
 
 		 508 aa  207  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0589773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0756  UxaA family hydrolase  34.94 
 
 		 514 aa  207  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3799  Altronate dehydratase  35.12 
 
 		 526 aa  207  4e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1952  Galactarate dehydratase  34.36 
 
 		 507 aa  206  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0590  Galactarate dehydratase  37.62 
 
 		 512 aa  206  6e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.413028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5155  Altronate dehydratase  34.46 
 
 		 515 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0806  UxaA family hydrolase  34.7 
 
 		 514 aa  204  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.941516  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4278  Altronate dehydratase  34.94 
 
 		 507 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569461  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3898  uronate isomerase  34.2 
 
 		 510 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.90307  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5792  Altronate dehydratase  34.06 
 
 		 523 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0724  Altronate dehydratase  34.4 
 
 		 515 aa  203  5e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1027  galactarate dehydratase  34.59 
 
 		 509 aa  203  6e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3967  Altronate dehydratase  33.57 
 
 		 508 aa  202  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.816529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0783  Galactarate dehydratase  34.78 
 
 		 508 aa  202  9e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1064  altronate hydrolase  31.92 
 
 		 505 aa  202  9e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.343724  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3576  Altronate dehydratase  34.05 
 
 		 510 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1862  galactarate dehydratase  34.88 
 
 		 538 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5795  Altronate dehydratase  35.19 
 
 		 523 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228862  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3225  Altronate dehydratase  35.02 
 
 		 501 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0179  galactarate dehydratase  35.73 
 
 		 507 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2068  Altronate dehydratase  34.74 
 
 		 511 aa  201  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3059  galactarate dehydratase  34.32 
 
 		 507 aa  199  9e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2945  putative D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase  34.56 
 
 		 507 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0792126  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3904  galactarate dehydratase  33.98 
 
 		 514 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1602  galactarate dehydratase  34.37 
 
 		 513 aa  197  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2082  galactarate dehydratase  36.28 
 
 		 509 aa  196  7e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.315134  normal  0.334548 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1702  Altronate dehydratase  34.46 
 
 		 508 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1749  Altronate dehydratase  32.3 
 
 		 510 aa  196  9e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548358  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2533  Galactarate dehydratase  34.07 
 
 		 533 aa  195  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6308  Altronate dehydratase  34.12 
 
 		 507 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6467  Altronate dehydratase  34.31 
 
 		 507 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457294  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6702  Altronate dehydratase  34.31 
 
 		 507 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0495  Altronate dehydratase  33.17 
 
 		 509 aa  188  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0154  Altronate dehydratase  35.07 
 
 		 500 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0475003  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5478  Altronate dehydratase  32.54 
 
 		 508 aa  187  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6103  D-galactarate dehydratase  33.25 
 
 		 510 aa  187  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2740  Altronate dehydratase  33.25 
 
 		 493 aa  186  6e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000642568  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0264  Altronate dehydratase  34.05 
 
 		 500 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.530336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0160  Galactarate dehydratase  34.72 
 
 		 500 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00621613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1610  altronate hydrolase  33.81 
 
 		 500 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1451  altronate hydrolase  32.83 
 
 		 388 aa  185  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0287  Altronate dehydratase  34.53 
 
 		 500 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1221  Altronate dehydratase  34.2 
 
 		 507 aa  183  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1754  Altronate dehydratase  35.06 
 
 		 514 aa  179  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1247  Altronate dehydratase  33.97 
 
 		 507 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.665181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3855  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain-containing protein  31.84 
 
 		 393 aa  176  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00201653  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2590  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like protein  33.99 
 
 		 384 aa  176  9e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0469328  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2216  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  31.62 
 
 		 387 aa  172  1e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.166546  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2003  Altronate dehydratase  32.76 
 
 		 387 aa  172  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2005  Altronate dehydratase  32.76 
 
 		 387 aa  172  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0892  Altronate dehydratase  32.39 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3804  Altronate dehydratase  32.41 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6357  Altronate dehydratase  33 
 
 		 384 aa  170  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.194037  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1766  Altronate dehydratase  34.98 
 
 		 389 aa  170  4e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0211518  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1597  galactarate dehydratase  32.56 
 
 		 532 aa  169  6e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3529  Altronate dehydratase  33.25 
 
 		 391 aa  169  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4320  Altronate dehydratase  30.77 
 
 		 496 aa  169  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3819  Altronate dehydratase  31.49 
 
 		 391 aa  168  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.257566  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0748  Altronate dehydratase  31.46 
 
 		 496 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3509  Altronate dehydratase  30.49 
 
 		 496 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6087  Altronate dehydratase  33.01 
 
 		 391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5298  Altronate dehydratase  31.33 
 
 		 384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3104  galactarate dehydratase  32.09 
 
 		 548 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1998  galactarate dehydratase  31.32 
 
 		 520 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.257982  normal  0.434412 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>