234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2945 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2834  UxaA family hydrolase  63.89 
 
 		 513 aa  635    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3059  galactarate dehydratase  74.16 
 
 		 507 aa  790    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3967  Altronate dehydratase  63.73 
 
 		 508 aa  645    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.816529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0783  Galactarate dehydratase  64.9 
 
 		 508 aa  654    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2945  putative D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase  100 
 
 		 507 aa  1040    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0792126  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2855  Altronate dehydratase  64.09 
 
 		 513 aa  635    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2948  galactarate dehydratase  64.09 
 
 		 513 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5795  Altronate dehydratase  61.81 
 
 		 523 aa  630  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228862  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5155  Altronate dehydratase  61.71 
 
 		 515 aa  626  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1027  galactarate dehydratase  62.85 
 
 		 509 aa  625  1e-178  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4928  galactarate dehydratase  61.71 
 
 		 508 aa  623  1e-177  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5792  Altronate dehydratase  61.02 
 
 		 523 aa  620  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1537  Altronate dehydratase  60.98 
 
 		 513 aa  612  9.999999999999999e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.281722 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6583  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  59.02 
 
 		 517 aa  600  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0600477  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0179  galactarate dehydratase  58.87 
 
 		 507 aa  598  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4448  Altronate dehydratase  57.79 
 
 		 508 aa  593  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0582  Altronate dehydratase  59.96 
 
 		 533 aa  587  1e-166  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1702  Altronate dehydratase  57.4 
 
 		 508 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6599  galactarate dehydratase  57.65 
 
 		 516 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0724  Altronate dehydratase  55.4 
 
 		 515 aa  567  1e-160  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1602  galactarate dehydratase  58.2 
 
 		 513 aa  564  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3970  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like  57.14 
 
 		 509 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0955  glycogen debranching protein GlgX  55.27 
 
 		 508 aa  555  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00705486  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4671  Altronate dehydratase  56.25 
 
 		 523 aa  556  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2068  Altronate dehydratase  58.55 
 
 		 511 aa  557  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1862  galactarate dehydratase  57.34 
 
 		 538 aa  557  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4278  Altronate dehydratase  55.19 
 
 		 507 aa  554  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569461  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6103  D-galactarate dehydratase  55.71 
 
 		 510 aa  550  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1615  putative altronate hydrolase (ALTRONIC acid hydratase) protein  55.29 
 
 		 519 aa  548  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135092  normal  0.0340906 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3576  Altronate dehydratase  54.44 
 
 		 510 aa  546  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5478  Altronate dehydratase  55.25 
 
 		 508 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4262  galactarate dehydratase  53.53 
 
 		 507 aa  544  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.892671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3904  galactarate dehydratase  54.79 
 
 		 514 aa  544  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0806  UxaA family hydrolase  55.23 
 
 		 514 aa  537  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.941516  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1952  Galactarate dehydratase  53.82 
 
 		 507 aa  537  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2347  galactarate dehydratase  53.65 
 
 		 509 aa  536  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0756  UxaA family hydrolase  54.94 
 
 		 514 aa  535  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1221  Altronate dehydratase  54.81 
 
 		 507 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2082  galactarate dehydratase  53.94 
 
 		 509 aa  527  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.315134  normal  0.334548 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1247  Altronate dehydratase  55.21 
 
 		 507 aa  528  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.665181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6308  Altronate dehydratase  54.01 
 
 		 507 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05270  altronate dehydratase  53.57 
 
 		 525 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6467  Altronate dehydratase  53.02 
 
 		 507 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457294  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6702  Altronate dehydratase  53.02 
 
 		 507 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3225  Altronate dehydratase  53.83 
 
 		 501 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1749  Altronate dehydratase  53.05 
 
 		 510 aa  508  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548358  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0590  Galactarate dehydratase  55.51 
 
 		 512 aa  503  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.413028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0495  Altronate dehydratase  50.69 
 
 		 509 aa  504  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3898  uronate isomerase  51.56 
 
 		 510 aa  501  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.90307  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2533  Galactarate dehydratase  50.18 
 
 		 533 aa  482  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0154  Altronate dehydratase  51.57 
 
 		 500 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0475003  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1610  altronate hydrolase  49.9 
 
 		 500 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0160  Galactarate dehydratase  51.56 
 
 		 500 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00621613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0264  Altronate dehydratase  50.2 
 
 		 500 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.530336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07160  altronate dehydratase  50.49 
 
 		 508 aa  477  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0589773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0287  Altronate dehydratase  49.11 
 
 		 500 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3799  Altronate dehydratase  45.94 
 
 		 526 aa  463  1e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0840  galactarate dehydratase  41.41 
 
 		 524 aa  347  3e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3265  galactarate dehydratase  43.43 
 
 		 530 aa  346  5e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.133789 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0806  galactarate dehydratase  40.63 
 
 		 524 aa  346  7e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4684  galactarate dehydratase  43.71 
 
 		 516 aa  344  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.360454  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1218  galactarate dehydratase  42.33 
 
 		 518 aa  339  7e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0502126  normal  0.0293032 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3318  galactarate dehydratase  39.84 
 
 		 523 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0577  galactarate dehydratase  39.84 
 
 		 523 aa  336  5.999999999999999e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02993  (D)-galactarate dehydrogenase  39.84 
 
 		 523 aa  335  9e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02944  hypothetical protein  39.84 
 
 		 523 aa  335  9e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0830  D-galactarate dehydratase  41 
 
 		 533 aa  335  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3425  galactarate dehydratase  39.84 
 
 		 523 aa  335  1e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0572  galactarate dehydratase  39.84 
 
 		 523 aa  335  1e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3608  galactarate dehydratase  40.12 
 
 		 523 aa  335  1e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4442  galactarate dehydratase  39.84 
 
 		 523 aa  335  1e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.648393 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3398  galactarate dehydratase  39.92 
 
 		 524 aa  334  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6490  (D)-galactarate dehydrogenase  41.77 
 
 		 513 aa  333  4e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4448  galactarate dehydratase  40.16 
 
 		 533 aa  333  5e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0860733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4582  galactarate dehydratase  40.16 
 
 		 533 aa  333  5e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.699937  normal  0.473159 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3513  galactarate dehydratase  40.37 
 
 		 523 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1778  galactarate dehydratase  43.44 
 
 		 534 aa  331  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479447  normal  0.643906 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3442  galactarate dehydratase  40.37 
 
 		 523 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3550  galactarate dehydratase  40.37 
 
 		 523 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0864027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3444  galactarate dehydratase  40.37 
 
 		 523 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3558  galactarate dehydratase  39.68 
 
 		 524 aa  329  7e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0190  D-galactarate dehydratase  40.04 
 
 		 564 aa  325  9e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2484  galactarate dehydratase  40.59 
 
 		 533 aa  325  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000132334 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0800  Altronate dehydratase  38.31 
 
 		 512 aa  324  2e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4547  D-galactarate dehydratase  41.02 
 
 		 517 aa  323  5e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.457968  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3570  galactarate dehydratase  38.95 
 
 		 523 aa  322  9.000000000000001e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.631935 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4225  galactarate dehydratase  41.22 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2315  galactarate dehydratase  41.4 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.761535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0830  galactarate dehydratase  41.37 
 
 		 517 aa  320  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.15069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1064  altronate hydrolase  35.71 
 
 		 505 aa  320  3e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.343724  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1998  galactarate dehydratase  40.61 
 
 		 520 aa  319  7.999999999999999e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.257982  normal  0.434412 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05250  D-galactarate dehydratase  40.37 
 
 		 517 aa  318  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2816  galactarate dehydratase  40.93 
 
 		 517 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0628742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1721  galactarate dehydratase  39.11 
 
 		 529 aa  315  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0799571  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3100  galactarate dehydratase  40.55 
 
 		 517 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3601  D-galactarate dehydratase, putative  40.34 
 
 		 517 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.271934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4734  galactarate dehydratase  39.19 
 
 		 530 aa  310  5.9999999999999995e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.481286  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1597  galactarate dehydratase  39.76 
 
 		 532 aa  309  6.999999999999999e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4865  galactarate dehydratase  37.14 
 
 		 529 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0784645  normal  0.0391217 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1754  Altronate dehydratase  39.29 
 
 		 514 aa  307  3e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>