234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0806 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1602  galactarate dehydratase  69.2 
 
 		 513 aa  724    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0806  UxaA family hydrolase  100 
 
 		 514 aa  1056    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.941516  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3970  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like  65.54 
 
 		 509 aa  669    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4671  Altronate dehydratase  70.06 
 
 		 523 aa  739    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6103  D-galactarate dehydratase  63.09 
 
 		 510 aa  671    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0756  UxaA family hydrolase  99.42 
 
 		 514 aa  1049    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3904  galactarate dehydratase  91.05 
 
 		 514 aa  979    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0582  Altronate dehydratase  55.92 
 
 		 533 aa  586  1e-166  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1537  Altronate dehydratase  56.89 
 
 		 513 aa  582  1.0000000000000001e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.281722 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0783  Galactarate dehydratase  57.06 
 
 		 508 aa  579  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3967  Altronate dehydratase  56.03 
 
 		 508 aa  574  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.816529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1027  galactarate dehydratase  55.4 
 
 		 509 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4928  galactarate dehydratase  55.21 
 
 		 508 aa  560  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3059  galactarate dehydratase  57.28 
 
 		 507 aa  561  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1862  galactarate dehydratase  56.89 
 
 		 538 aa  560  1e-158  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1749  Altronate dehydratase  56.92 
 
 		 510 aa  555  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548358  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5155  Altronate dehydratase  55.56 
 
 		 515 aa  555  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4278  Altronate dehydratase  54.37 
 
 		 507 aa  552  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569461  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2068  Altronate dehydratase  58.58 
 
 		 511 aa  553  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6583  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  53.95 
 
 		 517 aa  552  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0600477  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2855  Altronate dehydratase  54.35 
 
 		 513 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5795  Altronate dehydratase  54.64 
 
 		 523 aa  549  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228862  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2948  galactarate dehydratase  53.97 
 
 		 513 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439252  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2834  UxaA family hydrolase  54.74 
 
 		 513 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0955  glycogen debranching protein GlgX  52.94 
 
 		 508 aa  546  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00705486  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4448  Altronate dehydratase  54.04 
 
 		 508 aa  547  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5792  Altronate dehydratase  54.6 
 
 		 523 aa  547  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0179  galactarate dehydratase  55.18 
 
 		 507 aa  545  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6599  galactarate dehydratase  54.15 
 
 		 516 aa  544  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2945  putative D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase  55.47 
 
 		 507 aa  544  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0792126  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1952  Galactarate dehydratase  52.08 
 
 		 507 aa  540  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2347  galactarate dehydratase  52.86 
 
 		 509 aa  538  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3576  Altronate dehydratase  52.48 
 
 		 510 aa  540  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05270  altronate dehydratase  54.69 
 
 		 525 aa  540  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5478  Altronate dehydratase  53.37 
 
 		 508 aa  533  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2082  galactarate dehydratase  53.07 
 
 		 509 aa  532  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.315134  normal  0.334548 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3898  uronate isomerase  53.17 
 
 		 510 aa  531  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.90307  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4262  galactarate dehydratase  51.98 
 
 		 507 aa  530  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.892671  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1615  putative altronate hydrolase (ALTRONIC acid hydratase) protein  50.99 
 
 		 519 aa  526  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135092  normal  0.0340906 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6308  Altronate dehydratase  53.85 
 
 		 507 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6467  Altronate dehydratase  53.57 
 
 		 507 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457294  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6702  Altronate dehydratase  53.57 
 
 		 507 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0590  Galactarate dehydratase  55.51 
 
 		 512 aa  519  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.413028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1221  Altronate dehydratase  52.58 
 
 		 507 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1247  Altronate dehydratase  52.18 
 
 		 507 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.665181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0724  Altronate dehydratase  49.51 
 
 		 515 aa  518  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0495  Altronate dehydratase  49.8 
 
 		 509 aa  510  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1702  Altronate dehydratase  51.2 
 
 		 508 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3225  Altronate dehydratase  53.29 
 
 		 501 aa  508  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2533  Galactarate dehydratase  52.05 
 
 		 533 aa  503  1e-141  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07160  altronate dehydratase  51.19 
 
 		 508 aa  497  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0589773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1610  altronate hydrolase  51.6 
 
 		 500 aa  488  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0264  Altronate dehydratase  51.2 
 
 		 500 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.530336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0154  Altronate dehydratase  51.89 
 
 		 500 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0475003  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0287  Altronate dehydratase  50.6 
 
 		 500 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0160  Galactarate dehydratase  51.49 
 
 		 500 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00621613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3799  Altronate dehydratase  44.42 
 
 		 526 aa  447  1.0000000000000001e-124  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3442  galactarate dehydratase  39.76 
 
 		 523 aa  315  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3444  galactarate dehydratase  39.76 
 
 		 523 aa  315  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3513  galactarate dehydratase  39.76 
 
 		 523 aa  315  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3550  galactarate dehydratase  39.76 
 
 		 523 aa  315  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0864027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1754  Altronate dehydratase  39.2 
 
 		 514 aa  311  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4684  galactarate dehydratase  39.26 
 
 		 516 aa  311  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.360454  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3608  galactarate dehydratase  39.23 
 
 		 523 aa  311  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3318  galactarate dehydratase  39.23 
 
 		 523 aa  311  2e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02993  (D)-galactarate dehydrogenase  39.23 
 
 		 523 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4442  galactarate dehydratase  38.9 
 
 		 523 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.648393 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02944  hypothetical protein  39.23 
 
 		 523 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0577  galactarate dehydratase  39.23 
 
 		 523 aa  310  4e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0572  galactarate dehydratase  39.23 
 
 		 523 aa  310  4e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3425  galactarate dehydratase  39.23 
 
 		 523 aa  310  5e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0806  galactarate dehydratase  38.57 
 
 		 524 aa  310  5e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1064  altronate hydrolase  37.29 
 
 		 505 aa  309  6.999999999999999e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.343724  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3265  galactarate dehydratase  39.47 
 
 		 530 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.133789 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0840  galactarate dehydratase  38.49 
 
 		 524 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3398  galactarate dehydratase  37.95 
 
 		 524 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6490  (D)-galactarate dehydrogenase  37.63 
 
 		 513 aa  303  6.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3570  galactarate dehydratase  38.8 
 
 		 523 aa  302  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.631935 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3558  galactarate dehydratase  37.75 
 
 		 524 aa  301  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0691  Altronate dehydratase  35.43 
 
 		 496 aa  300  4e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4320  Altronate dehydratase  36.03 
 
 		 496 aa  297  4e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3383  altronate dehydratase  36.55 
 
 		 495 aa  295  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3527  altronate dehydratase  36.55 
 
 		 495 aa  295  1e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1778  galactarate dehydratase  39.16 
 
 		 534 aa  295  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479447  normal  0.643906 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3559  altronate dehydratase  36.55 
 
 		 495 aa  294  3e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02960  altronate hydrolase  36.55 
 
 		 495 aa  292  9e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3274  altronate dehydratase  36.55 
 
 		 495 aa  292  9e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0609  Altronate dehydratase  36.55 
 
 		 495 aa  292  9e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02911  hypothetical protein  36.55 
 
 		 495 aa  292  9e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4406  altronate dehydratase  36.55 
 
 		 495 aa  292  9e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.731196 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0610  Altronate dehydratase  36.35 
 
 		 495 aa  291  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0228  D-altronate dehydratase  38.49 
 
 		 503 aa  290  5.0000000000000004e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0800  Altronate dehydratase  35.1 
 
 		 512 aa  288  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2484  galactarate dehydratase  35.87 
 
 		 533 aa  285  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000132334 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1218  galactarate dehydratase  37.86 
 
 		 518 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0502126  normal  0.0293032 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3545  D-altronate dehydratase  35.32 
 
 		 495 aa  285  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0531  Altronate dehydratase  35.09 
 
 		 496 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1102  altronate hydrolase  35.29 
 
 		 496 aa  284  3.0000000000000004e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1575  Altronate dehydratase  37.32 
 
 		 498 aa  284  3.0000000000000004e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0493  altronate dehydratase  35.29 
 
 		 496 aa  284  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>